| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 393,907 | A→G | K194E (AAA→GAA) | yaiW → | surface‑exposed outer membrane lipoprotein YaiW |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 393,907 | 0 | A | G | 100.0% | 91.1 / NA | 26 | K194E (AAA→GAA) | yaiW | surface‑exposed outer membrane lipoprotein YaiW |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (10/16); total (10/16) | |||||||||||
TTTTTGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAATTATCCCGCCAGTTATAGCGCACCGATATACCGTTTTGCTGATTTTAACG > NZ_CP009273/393776‑394033 | tttttGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGa < 2:184815/139‑1 (MQ=255)tttttGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGa < 2:365047/139‑1 (MQ=255) tGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCtt > 2:577217/1‑139 (MQ=255) tGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCtt > 2:348027/1‑139 (MQ=255) gCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTcgccgc > 2:49628/1‑139 (MQ=255) tGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGtt > 1:746773/1‑139 (MQ=255) tttGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTtg < 1:139534/138‑1 (MQ=255) tttGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTtg < 2:699132/138‑1 (MQ=255) tttGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTtg < 1:49628/138‑1 (MQ=255) tttGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTtg < 2:249031/138‑1 (MQ=255) tttGGTGCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTtg < 1:588315/138‑1 (MQ=255) aaTCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTAc < 1:577217/137‑1 (MQ=255) cgcACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTa < 2:631090/138‑1 (MQ=255) gTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTAcc < 1:190225/126‑1 (MQ=255) gTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTAcc > 2:190225/1‑126 (MQ=255) ggCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGGTTGGTACTTACCATTTACTGAATTATcc > 2:720929/1‑139 (MQ=255) aTGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAATTATCCCGc > 1:437626/1‑137 (MQ=255) gTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCgcggc > 2:372192/1‑90 (MQ=255) gTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCgcggc < 1:372192/90‑1 (MQ=255) aaTTGCTTTTGCCGAGCAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGCCCGTCAGGAAGTATTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAATTATCCCGCCAGTTATAGCGCa < 2:248699/138‑1 (MQ=255) aTTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAATTATCCCGCCAGTTATAGCGCAc < 2:437626/139‑1 (MQ=255) cAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAATTATCCCGCCAGTTATAgcg > 2:428406/1‑121 (MQ=255) cAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAATTATCCCGCCAGTTATAgcg < 1:428406/121‑1 (MQ=255) gggTATCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAATTATCCCGCCAGTTATAGCGCACCGATATACCGTTTTGCTGATTTTAACg < 1:348027/139‑1 (MQ=255) tCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAATTATCCCGc > 2:38184/1‑93 (MQ=255) tCCGTGGGAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAATTATCCCGc < 1:38184/93‑1 (MQ=255) | TTTTTGACGATCTGATCAACATGGTGCCAATGGGGCAGACGCTGTTTGGTTCGCTCAATCCGGTGCGCACCGGTGGGCCGATGCAGGTCAGCATTGCTTTTGCCGAACAGCATACCAAAGGGTATCCGTGGAAAATGGACGGTACAGTCCGTCAGGAAGTCTTCAGTCGCCGCGGCGGGTTGTGGTTTGGTACTTACCATTTACTGAATTATCCCGCCAGTTATAGCGCACCGATATACCGTTTTGCTGATTTTAACG > NZ_CP009273/393776‑394033 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |