Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 1,083,520 | A→G | P598P (CCT→CCC) | pgaB ← | poly‑beta‑1,6‑N‑acetyl‑D‑glucosamine N‑deacetylase PgaB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 1,083,520 | 0 | A | G | 100.0% | 48.3 / NA | 14 | P598P (CCT→CCC) | pgaB | poly‑beta‑1,6‑N‑acetyl‑D‑glucosamine N‑deacetylase PgaB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (5/9); total (5/9) |
ATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTCCAGTCATAGCTTTTTAGGAAATCAGCATAATTCTGTG > NZ_CP009273/1083388‑1083653 | aTAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGgggg > 1:11527/1‑136 (MQ=255) aTAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGgggg < 2:11527/136‑1 (MQ=255) tAATAGGCCCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGCACTAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGCTTTGTCTTTAGCCTGGGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTg > 2:392333/1‑138 (MQ=255) aaaTAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGGGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACAcc > 2:476452/1‑139 (MQ=255) aTAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGGGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCtt < 2:598984/139‑1 (MQ=255) tAGCCTGATGCTGACCATTGATCTGCCCGTTGTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGGGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTc < 1:186812/139‑1 (MQ=255) aTGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGGGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGAt > 1:53545/1‑137 (MQ=255) cTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGGGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGc < 2:351932/139‑1 (MQ=255) aCCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGGGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCa > 1:606035/1‑137 (MQ=255) aCCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGGGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCAt < 2:53545/138‑1 (MQ=255) ccTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGGGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTCCAGTCAt < 2:393952/138‑1 (MQ=255) aTAGATTTGTCTTTAGCCTGGGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTCCAGTCATAGCTTTTTAGGAAAt < 2:307989/139‑1 (MQ=255) tttGTCTTTAGCCTGGGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTCCAGTCATAGCCTTTTAGGAAATCAGCa < 1:392333/139‑1 (MQ=255) ttGTCTTTAGCCTGGGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGc > 1:521890/1‑93 (MQ=255) ttGTCTTTAGCCTGGGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGc < 2:521890/93‑1 (MQ=255) gCCTGGGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTCCAGTCATAGCTTTTTAGGAAATCAGCATAATTCtgtg < 1:476452/139‑1 (MQ=255) | ATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTCTGCCAGTTTTGTGCCTGTAATTCTAAAATAGATTTGTCTTTAGCCTGAGGGATGTTTTTAATTTGATTGGTCAATTGTATTAACCATTGGTCAGCCGATTTTTCTGCGACACCTTCCAGATAAGGCATAGCCATAATAGCGGTCCAGTCATAGCTTTTTAGGAAATCAGCATAATTCTGTG > NZ_CP009273/1083388‑1083653 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |