| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 2,065,124 | T→G | G35G (GGT→GGG) | agn43 → | autotransporter adhesin Ag43 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 2,065,124 | 0 | T | G | 100.0% | 67.3 / NA | 20 | G35G (GGT→GGG) | agn43 | autotransporter adhesin Ag43 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (12/8); total (12/8) | |||||||||||
TTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGAAACGACATCTGAATACCTGCTACAGGCTGGTATGGAATCACATGACGGGCGCTTTCGTGGTTGCCTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACGTGGCGGTGTGGCGGTTGCACTGTCTCTTGCCGCAGTCACGTCACTCCCGGTGCTGGCTGCTGACATCGTTGTGCACCCGGGAGAAACCGTGAACGGCGGAACACTGGCAAATCATGACAACCAGATTGTCTTCGGTACGAC > NZ_CP009273/2064989‑2065258 | ttttATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGAAACGACATCTGAATACCTGCTACAGGCTGGTATGGAATCACATGACGGGCGCTTTCGTGGTTGCCTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACgtggcggggt < 1:38516/138‑1 (MQ=255) ttCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGAAACGACATCTGAATACCTGCTACAGGCTGGTATGGAATCACATGACGGGCGCTTTCGTGGTTGCCTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACgtggcggggtggcggt < 1:631230/139‑1 (MQ=255) ccTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGAAACGACATCTGAATACCTGCTACAGGCTGGTATGGAATCACATGACGGGCGCTTTCGTGGTTGCCTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACGTGGCGGGGTGGCGGTTGCAc > 1:251138/1‑139 (MQ=255) aGCTGATGAAACGACATCTGAATACCTGCTACAGGCTGGTATGGAATCACATGACGGGCGCTTTCGTGGTTGCCTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACGTGGCGGGGTGGCGGTTGCACTGTCTCTTGCCGCAgt < 1:554571/139‑1 (MQ=255) aGCTGATGAAACGACATCTGAATACCTGCTACAGGCTGGTATGGAATCACATGACGGGCGCTTTCGTGGTTGCCTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACGTGGCGGGGTGGCGGGTGGACTGGCTCTTGcccccgg > 2:298915/1‑134 (MQ=255) gCTACAGGCTGGTATGGAATCACATGACGGGCGCTTTCGTGGTTGCCTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACgtggcggggtggcg > 2:339373/1‑89 (MQ=255) gCTACAGGCTGGTATGGAATCACATGACGGGCGCTTTCGTGGTTGCCTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACgtggcggggtggcg < 1:339373/89‑1 (MQ=255) gCTACAGGCTGGTATGGAATCACATGACGGGCGCTTTCGTGGTTGCCTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGGAAACGTGGCGGGGTGGCGGTTGCACTGTCTCTTGCCGCAGGCACGTCACTCCCGGGGCTGGctgctgg > 2:609977/1‑138 (MQ=255) cTACAGGCTGGTATGGAATCACATGACGGGCGCTTTCGTGGTTGCCTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACgtggcgggggggcgggt > 2:319531/1‑89 (MQ=255) cTACAGGCTGGTATGGAATCACATGACGGGCGCTTTCGTGGTTGCCTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACGTGGCGGGGTGGCGGtt < 1:319531/91‑1 (MQ=255) gTATGGAATCACATGACGGGCGCTTTCGTGGTTGCCTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACGTGGCGGGGTGGCGGTTGCACTGTCTCTTGCCGCAGTCACGTCACTCCCGGTGCTGGCTGCTGACATCGTTGTGc < 1:507725/139‑1 (MQ=255) acaTGACGGGCGCTTTCGTGGTTGCCTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACGTGGCGGGGTGGCGGTTGCACTGTCTCTTGCCGCAGTCACGTCACTCCCGGTGCTGGCTGCTGACATCGTTGTGCACCCGGgag < 2:363482/138‑1 (MQ=255) acaTGACGGGCGCTTTCGTGGTTGCCTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACGTGGCGGGGTGGCGGTTGCACTGTCTCTTGCCGCAGTCACGTCACTCCCGGTGCTGGCTGCTGACATCGTTGTGCACCCGGgag < 1:298915/138‑1 (MQ=255) caTGACGGGCGCTTTCGTGGTTGCCTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACGTGGCGGGGGGGCGGTTGCACTGTCTCTTGCCGCAGACACGTCACTCCCGGGGCTGGCTGCTGGCCTCGTTGTGCCACCGGga > 2:116405/1‑136 (MQ=255) caTGACGGGCGCTTTCGTGGTTGCCTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACGTGGCGGGGGGGCGGGTGCACTGGCTCTTGCCGCAGTCAAGGCACTCCCGGGGGTGGCTGCTGACATCGTTGTGCACCCgggggg > 2:507725/1‑135 (MQ=255) cGGGCGCTTTCGTGGTTGCCTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACGTGGCGGGGTGGCGGTTGCACTGTCTCTTGCCGCAGTCACGTCACTCCCGGTGCTGGCTGCTGACATCGTTGTGCACCCGGGAGAAACCGt > 1:427175/1‑139 (MQ=255) cGGGCGCTTTCGTGGTTGCCTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACGTGGCGGGGTGGCGGTTGCACTGTCTCTTGCCGCAGTCACGGCACTCCCGGTGCTGGCTGCTGACATCGTTGTGCACCCGGGAGAAAACGt > 1:289950/1‑139 (MQ=255) cGGGCGCTTTCGTGGTTGCCTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACGTGGCGGGGTGGCGGGTGCACTGTCTCCTGCCGCAGTAACGTCACTCCCGGTGCTGGCTGGTGACATCGTTGTACACCCGGGGGANNnc > 2:209355/1‑137 (MQ=255) gcgcTTTCGTGGTTGCCTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACGTGGCGGGGTGGCGGTTGCACTGTCTCTTGCCGCAGTCACGTCACTCCCGGTGCTGGCTGCTGACATCGTTGTGCACCCGGGAGAAACCGTGaa < 1:423356/139‑1 (MQ=255) tCGTGGTTGCCTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACGTGGCGGGGTGGCGGTTGCACTGTCTCTTGCCGCAGTCACGTCCCTCCCGGGGCTGGCTGCTGACATCGTTGTGCACCCGGGAGAAACCGTGAAcggcg > 1:46205/1‑138 (MQ=255) cTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACGTGGCGGGGTGGCGGTTGCACTGTCTCTTGCCGCAGGCACGGCACTCCCGGGGCTGGCTGCTGACATCGTTGTGCCCCCGGGAGACACCGTGAAC‑CCGGAACACTGGCa > 2:184132/1‑138 (MQ=255) gCCCGCGCACGGGGTAAACGTGGCGGGGTGGCGGTTGCACTGTCTCTTGCCGCAGTCACGTCACTCCCGGTGCTGGCTGCTGACATCGTTGTGCACCCGGGAGAAACCGTGAACGGCGGAACACTGGCAAATCATGAc > 1:464492/1‑138 (MQ=255) cACGGGGTAAACGTGGCGGGGTGGCGGTTGCACTGTCTCTTGCCGCAGTCACGTCACTCCCGGTGCTGGCTGCTGACATCGTTGTGCACCCGGGAGAAACCGTGAACGGCGGAACACTGGCAAATCATGACAACCAGAt < 1:209355/139‑1 (MQ=255) ggggTAAACGTGGCGGGGTGGCGGTTGCACTGTCTCTTGCCGCAGTCACGTCACTCCCGGTGCTGGCTGCTGACa < 2:112549/75‑1 (MQ=255) ggggTAAACGTGGCGGGGTGGCGGTTGCACTGTCTCTTGCCGCAGTCACGTCACTCCCGGTGCTGGCTGCTGACa > 1:112549/1‑75 (MQ=255) gtggcggggtggcggtTGCACTGTCTCTTGCCGCAGTCACGTCACTCCCGGTGCTGGCTGCTGACATCGTTGTGCACCCGGGAGAAACCGTGAACGGCGGAACACTGGCAAATCATGACAACCAGATTGTCTTCGGTAc < 2:145757/139‑1 (MQ=255) gcggggtggcggtTGCACTGTCTCTTGCCGCAGTCACGTCACTCCCGGTGCTGGCTGCTGACa < 1:568996/63‑1 (MQ=255) gcggggtggcggtTGCACTGTCTCTTGCCGCAGTCACGTCACTCCCGGTGCTGGCTGCTGACa > 2:568996/1‑63 (MQ=255) gcggggtggcggtTGCACTGTCTCTTGCCGCAGTCACGTCACTCCCGGGGCTGGCTGCTGACATCGTTGTGCACCCGGGGGGAACCGTGAACGGCGGAACACTGGCAAATCATGACAACCAGATTGTCTTTGGTaacac > 2:6766/1‑135 (MQ=255) | TTTTATTCACCCTCAATCTAAGGAAAAGCTGATGAAACGACATCTGAATACCTGCTACAGGCTGGTATGGAATCACATGACGGGCGCTTTCGTGGTTGCCTCCGAACTGGCCCGCGCACGGGGTAAACGTGGCGGTGTGGCGGTTGCACTGTCTCTTGCCGCAGTCACGTCACTCCCGGTGCTGGCTGCTGACATCGTTGTGCACCCGGGAGAAACCGTGAACGGCGGAACACTGGCAAATCATGACAACCAGATTGTCTTCGGTACGAC > NZ_CP009273/2064989‑2065258 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |