Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 322,719 | 0 | T | C | 58.6% | 19.4 / 97.8 | 70 | G80G (GGA→GGG) | betA | choline dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (15/14); new base C (22/19); total (37/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
TAGTAGGGCAGGCAGTCGAGGTAGCTCCAGTTCTCCAGACCGGGTTCTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCAGGGCAGCGGGCATCTGGGTGCGGAAGTCAAAGCGATAGTCCGGGCCGC > NZ_CP009273/322585‑322855 | tagtagGGCAGGCAGTCGAGGTAGCTCCAGTTCTCCAGACCGGGTTCTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGc < 2:572304/139‑1 (MQ=255) gtagGGCAGGCAGTCGAGGTAGCTCCAGTTCTCCAGACCGGGTTCTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCa < 1:68464/138‑1 (MQ=255) tagGGCAGGCAGTCGAGGTAGCTCCAGTTCTCCAGACCGGGTTCTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACt < 1:265262/139‑1 (MQ=255) tagGGCAGGCAGTCGAGGTAGCTCCAGTTCTCCAGACCGGGTTCTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACt < 1:283604/139‑1 (MQ=255) ttgAGGTAGCTCCAATTCTCCAGACCGTGTTATTACGCCCAGTTATCGATATCCAGCGCATTGCCCCGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGAAGATCCACCCAGGCCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGt < 2:297380/137‑1 (MQ=255) tCGAGGTAGCTCCAGTTCTCCAGACCGGGTTCTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGt < 1:375299/139‑1 (MQ=255) gCTCCAGTTCTCCCGACCGGGTTCTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCAt > 1:501686/1‑138 (MQ=255) gCTCCAGTTCTCCAGACCGGGTTCTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATa < 1:237412/139‑1 (MQ=255) tCCAGTTCTCCAGACCGGGTTCTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATaaa > 1:340648/1‑139 (MQ=255) tCCAGTTCTCCAGACCGGGTTCTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATaaa > 1:574333/1‑139 (MQ=255) cAGTTCTCCAGACCGGGTTCTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAAc < 1:569080/138‑1 (MQ=255) cAGACCGGGTTCTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGt > 1:444428/1‑139 (MQ=255) aCCGGGTTCTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTcc > 1:121172/1‑139 (MQ=255) ccGGGTTCTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCg < 2:347060/139‑1 (MQ=255) ggTTCTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGttt > 1:124215/1‑139 (MQ=255) ggTTCTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAgg > 2:262511/1‑131 (MQ=255) ggTTCTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAgg < 1:262511/131‑1 (MQ=255) gTTCTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGttt > 2:518179/1‑138 (MQ=255) cTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCAt < 2:412493/138‑1 (MQ=255) tGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAgg > 2:163456/1‑139 (MQ=255) gcgcCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCCTAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGc > 1:529107/1‑139 (MQ=255) cgcCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGTcc < 1:27577/139‑1 (MQ=255) cgcCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGcc < 2:483713/139‑1 (MQ=255) cgcCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGcc < 1:352074/139‑1 (MQ=255) cgcCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGcc < 1:144051/139‑1 (MQ=255) ttATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGt < 2:258427/139‑1 (MQ=255) gagaTCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGt < 2:121172/139‑1 (MQ=255) gagaTCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGt < 2:501686/139‑1 (MQ=255) ccAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTAcc > 2:382331/1‑139 (MQ=255) tGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGGTCCGTTTCCTACGCCCCGGTGTAGCGTTTACCCTGTAGCgg > 2:412638/1‑139 (MQ=255) tGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCgg > 1:31789/1‑139 (MQ=255) ccACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCggg < 1:518179/138‑1 (MQ=255) ccACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCggg < 2:31789/138‑1 (MQ=255) ccACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCggg < 2:383614/138‑1 (MQ=255) aGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCAggg > 1:163293/1‑138 (MQ=255) gCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCAGGGCa < 2:356006/139‑1 (MQ=255) acaTGCCGTTGATCAGCGCCGATCCACCGAAGCCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCAGGGCAGc < 1:157445/139‑1 (MQ=255) tGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAAAGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCGCAGTTGTAGGGTTTAACCTGTAGCGGGAAAGCCAGGGCAGCggg > 2:124373/1‑139 (MQ=255) tGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCCTAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCAGGGCa > 2:138086/1‑134 (MQ=255) tGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCAGGGCa < 1:138086/134‑1 (MQ=255) tGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCAGGGCAGCggg > 1:189577/1‑139 (MQ=255) tGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCAGGGCAGCggg > 1:221203/1‑139 (MQ=255) tGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCAGGGCAGCggg > 1:27888/1‑139 (MQ=255) tGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCAGGGCAGCggg > 2:242883/1‑139 (MQ=255) tGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGGTCAGGTACCGTTTCATAGGCCCAGTTTTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGGATGCCAGGGCAGCggg > 1:132560/1‑139 (MQ=255) gCCGTTTATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCa > 1:526872/1‑128 (MQ=255) gCCGTTTATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCa < 2:526872/128‑1 (MQ=255) gTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCCTAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCAGGGCAGCGGGCATc > 2:449908/1‑139 (MQ=255) ttGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCAGGGCAGCGGGCATCt > 1:462293/1‑139 (MQ=255) cgacgaTCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGt < 2:222848/72‑1 (MQ=255) cgacgaTCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGt > 1:222848/1‑72 (MQ=255) cgacgaTCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCAGGGCAGCGGGCATCTGGGTGCgg > 2:192559/1‑139 (MQ=255) cgacgaTCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGGTCCGTTTCATAGGCCCCGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCAGGGCAGCGGGCATCTGGGTGCgg > 2:231544/1‑139 (MQ=255) acgaTCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGGTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTAACCTGTAGCGGGAATGCCAGGGCAGCGGGCATCTgggggggg > 2:243204/1‑132 (MQ=255) aTCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCAGGGCa > 2:33874/1‑116 (MQ=255) aTCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCAGGGCa < 1:33874/116‑1 (MQ=255) aTCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGGTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGGATGCCAGGGCAGCGGGCATCTGGGGGCGGAAgg > 2:386481/1‑137 (MQ=255) tCCACCCAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCAGGGCAGCGGGCATCTGGGTGCGGAAGTCa < 2:310865/139‑1 (MQ=255) cccAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGGATGCCAGGGCAGCGGGCATCTGGGTGCGGGAGTCAAAGc > 2:168992/1‑139 (MQ=255) cccAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTAcc < 1:64497/89‑1 (MQ=255) cccAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTAcc > 2:64497/1‑89 (MQ=255) ccAGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCAGGGCAGCGGGCATCTGGGTGCGGAAGTCAAAGCg < 2:574333/139‑1 (MQ=255) aGACCTTTACCGCGCCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGGTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCAGGGCAGCGGGCATCTGGGTGCGGGAGTCAAAGCGa > 2:439301/1‑138 (MQ=255) aCCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCCGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCAGGGCAGCGGGCATCTGGGGGCGGAAGTCAAAGCGATAg > 2:116205/1‑139 (MQ=255) aCCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCAGGGCAGCGGGCATCTGGGTGCGGAAGTCAAAGCGATAg > 1:388360/1‑139 (MQ=255) aCCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCAGGGCAGCGGGCATCTGGGTGCGGAAGTCAAAGCGATAg > 1:46195/1‑139 (MQ=255) cgTCCGCGCTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGATTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCAGGGCAGCGGGCATCTGGGTGCGGAAGTCAAAGCGATAGTCCGGgccgc < 2:159269/139‑1 (MQ=255) cgTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCAGGGCAGCGGGCATCTGGGTGCGGAAGTCAAAGCGATAGTcc < 1:471227/132‑1 (MQ=255) cgTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCAGGGCAGCGGGCATCTGGGTGCGGAAGTCAAAGCGATAGTCCGGgccgc < 2:340648/139‑1 (MQ=255) cgTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGGTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCAGGGCAGCGGGCATCTGGGTGCGGAAGTCAAAGCGATAGTcc > 2:471227/1‑132 (MQ=255) | TAGTAGGGCAGGCAGTCGAGGTAGCTCCAGTTCTCCAGACCGGGTTCTTGCGCCCAGTTATCGAGATCCAGCGCATTGCCACGGATGTAGCACATGCCGTTGATCAGCGACGATCCACCCAGACCTTTACCGCGTCCGCACTCCATGCGGCGGTTATTCATAAACGGTTCAGGTTCCGTTTCATAGGCCCAGTTGTAGCGTTTACCCTGTAGCGGGAATGCCAGGGCAGCGGGCATCTGGGTGCGGAAGTCAAAGCGATAGTCCGGGCCGC > NZ_CP009273/322585‑322855 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |