Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 351,822 | 0 | T | C | 63.9% | 74.9 / 94.5 | 83 | I397T (ATC→ACC) | codB | cytosine permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (16/14); new base C (28/25); total (44/39) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.68e-01 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
TTGCGACCACGCGTATGATGAGTGTCAATTGGGTGGCGATTCTGGCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTACAAACAATTATTAACGCCCGGTTACCAGGCGAAGAGGGGCTGTGGCAGATTCATCTGCAG > NZ_CP009273/351690‑351959 | ttGCGACCACGCGTATGATGAGTGTCAATTGGGTGGCGATTCTGGCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTaa > 2:453681/1‑139 (MQ=255) cgcgTATGATGAGTGTCAATTGGGTGGCGATTCTGGCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGAtttt > 1:567484/1‑139 (MQ=255) cgcgTATGATGAGTGTCAATTGGGTGGCGATTCTGGCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGAtttt > 1:531004/1‑139 (MQ=255) cgcgTATGATGAGTGTCAATTGGGTGGCGATTCTGGCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGGTACAGGGAATTGTTCCGGTCAAGGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGGTATCTGATCCTTAAgcctgtctc > 2:235632/1‑133 (MQ=255) tATGATGAGTGTCAATTGGGTGGCGATTCTGGCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAAt > 1:525790/1‑139 (MQ=255) aGTGTCAATTGGGTGGCGATTCTGGCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTaaaa > 1:385282/1‑139 (MQ=255) aGTGTCAATTGGGTGGCGATTCTGGCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTaaaa > 2:97758/1‑139 (MQ=255) aGTGTCAATTGGGTGGCGATTCTGGCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTaaaa > 2:556988/1‑139 (MQ=255) aGTGTCAATTGGGTGGCGATTCTGGCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTaaaa > 1:137451/1‑139 (MQ=255) tCAATTGGGTGGCGATTCTGGCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGa > 1:114620/1‑138 (MQ=255) aaTTGGGTGGCGATTCTGGCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGAcag < 1:556988/139‑1 (MQ=255) aTTGGGTGGCGATTCTGGCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGAcag > 2:350150/1‑138 (MQ=255) aTTGGGTGGCGATTCTGGCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGAcag > 1:121722/1‑138 (MQ=255) aTTGGGTGGCGATTCTGGCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGAcag > 2:251510/1‑138 (MQ=255) ggTGGCGATTCTGGCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAgcagca < 2:567484/139‑1 (MQ=255) ggTGGCGATTCTGGCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAgcagca < 2:121722/139‑1 (MQ=255) gTGGCGATTCTGGCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCaa > 1:17765/1‑139 (MQ=255) tGGCGATTCTGGCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAAt < 1:350150/139‑1 (MQ=255) gCGATTCTGGCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGa < 1:534724/139‑1 (MQ=255) cGATTCTGGCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGAc < 1:251510/139‑1 (MQ=255) gATTCTGGCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACg < 1:159142/139‑1 (MQ=255) gCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCAtgtg < 1:302761/138‑1 (MQ=255) gCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCAtgtg < 1:449156/138‑1 (MQ=255) gCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCAtgtg < 2:17765/138‑1 (MQ=255) gCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCAtgtg < 2:144883/138‑1 (MQ=255) gCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCAtgtg < 2:137451/138‑1 (MQ=255) gCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCAtgtg < 2:66425/138‑1 (MQ=255) ccTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTaa < 2:130020/139‑1 (MQ=255) ccTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTaa < 1:244146/139‑1 (MQ=255) gggATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAgtg < 2:531004/139‑1 (MQ=255) gggATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAGCCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAgtg < 1:393077/139‑1 (MQ=255) gggATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAgtg < 2:185979/139‑1 (MQ=255) tgctgcAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGaa > 2:436089/1‑139 (MQ=255) gctgcAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACa < 1:222067/130‑1 (MQ=255) gctgcAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACa > 2:222067/1‑130 (MQ=255) gctgcAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTaa > 1:558408/1‑95 (MQ=255) gctgcAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTaa < 2:558408/95‑1 (MQ=255) cTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACagcagc < 2:310721/96‑1 (MQ=255) cTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACagcagc > 1:310721/1‑96 (MQ=255) cTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTaca < 1:398255/139‑1 (MQ=255) cTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTac > 2:492700/1‑138 (MQ=255) tGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTaca > 2:357583/1‑138 (MQ=255) tGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTaca > 1:293404/1‑138 (MQ=255) tGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTaca > 2:578160/1‑138 (MQ=255) gTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTacaaa < 2:45036/138‑1 (MQ=255) cGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCAtgtg < 1:177673/101‑1 (MQ=255) cGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCAtgtg > 2:177673/1‑101 (MQ=255) cGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTaca > 2:395528/1‑131 (MQ=255) cGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTaca < 1:395528/131‑1 (MQ=255) cGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTACAAACAatta > 2:275268/1‑139 (MQ=255) gAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCAtgtg < 1:24811/98‑1 (MQ=255) gAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCAtgtg > 2:24811/1‑98 (MQ=255) aaTTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTACAAACAATTATTaa < 1:579070/139‑1 (MQ=255) aTTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTACAAACAATTATTAAc < 1:32366/139‑1 (MQ=255) ttCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTACAAACAATTATTAACGccc > 1:279476/1‑139 (MQ=255) gTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTACAAACAATTATTAACGCCCGGTTa > 2:238533/1‑139 (MQ=255) aaCGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTACAAACAATTATTAACGCCCGGTTAc > 2:122851/1‑137 (MQ=255) aaCGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTACAAACAATTATTAACGCCCGGTTAc > 1:239344/1‑137 (MQ=255) cgcgGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTACAAACAATTATTAACGCCCGGTTACCAgg < 2:486609/139‑1 (MQ=255) cgcgGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTACAAACAATTATTAACGCCCGGTTACCAgg < 1:275268/139‑1 (MQ=255) gTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCAtgtg < 2:299722/71‑1 (MQ=255) gTGGCGCGCTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCAtgtg > 1:299722/1‑71 (MQ=255) cgcgcTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACa < 1:86789/77‑1 (MQ=255) cgcgcTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACa > 2:86789/1‑77 (MQ=255) cgcgcTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTACAAACAATTATTAACGCCCGGTTAc < 1:100664/120‑1 (MQ=255) cgcgcTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTACAAACAATTATTAACGCCCGGTTAc > 2:100664/1‑120 (MQ=255) cgcgcTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTACAAACAATTATTAACGCCCGGTTACCAGGCGAAGAGGGGCtgtg > 1:319915/1‑139 (MQ=255) cgcgcTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTACAAACAATTATTAACGCCCGGTTACCAGGCGAAGAGGGGCtgtg > 2:102331/1‑139 (MQ=255) cgcgcTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTACAAACAATTATTAACGCCCGGTTACCAGGCGAAGAGGGGCtgtg > 1:546082/1‑139 (MQ=255) cgcgcTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGAc > 1:423771/1‑60 (MQ=255) cgcgcTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGAc < 2:423771/60‑1 (MQ=255) cgcgcTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCAtgtg < 2:581970/67‑1 (MQ=255) cgcgcTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCAtgtg > 1:581970/1‑67 (MQ=255) cgcgcTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTACAAACAATTATTAACGcc > 2:414581/1‑113 (MQ=255) cgcgcTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTACAAACAATTATTAACGcc < 1:414581/113‑1 (MQ=255) cgcgcTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTACAAACAATTATTAACGCCCGGTTAc > 2:277284/1‑120 (MQ=255) cgcgcTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTACAAACAATTATTAACGCCCGGTTAc < 1:277284/120‑1 (MQ=255) cgcgcTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTACAAACAATTATTAACGCCCGGTTACCAgg < 1:59937/124‑1 (MQ=255) cgcgcTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTACAAACAATTATTAACGCCCGGTTACCAgg > 2:59937/1‑124 (MQ=255) cgcgcTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTACAAACAATTATTAACGCCCGGTTACCAGGCGAAGAGGGGCtgtg > 2:156317/1‑139 (MQ=255) cgcgcTGAGCTATCTGACCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTACAAACAATTATTAACGCCCGGTTACCAGGCGAAGAGGGGCtgtg > 1:453753/1‑139 (MQ=255) cgcTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTACAAACAATTATTAACGCCCGGTTACCAGGCGAAGAGGGGCTGTgg > 2:117630/1‑138 (MQ=255) gcTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTACAAACAATTATTAACGCCCGGTTACCAGGCGAAGAGGGGCTGTGGCa < 1:63305/139‑1 (MQ=255) tCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTACAAACAATTATTAACGCCCGGTTACCAGGCGAAGAGGGGCTGTGGCAGATTCATCTGCAg > 2:265520/1‑138 (MQ=255) | TTGCGACCACGCGTATGATGAGTGTCAATTGGGTGGCGATTCTGGCGGTCGCCTTGGGGATTGCTGCAGGCCACTGGTTACCGGGAATTGTTCCGGTCAACGCGGTATTAGGTGGCGCGCTGAGCTATCTGATCCTTAACCCGATTTTGAATCGTAAAACGACAGCAGCAATGACGCATGTGGAGGCTAACAGTGTCGAATAACGCTTTACAAACAATTATTAACGCCCGGTTACCAGGCGAAGAGGGGCTGTGGCAGATTCATCTGCAG > NZ_CP009273/351690‑351959 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |