Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 1,492,661 | A→G | M517V (ATG→GTG) | opgD → | glucan biosynthesis protein OpgD |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 1,492,661 | 0 | A | G | 100.0% | 115.5 / NA | 33 | M517V (ATG→GTG) | opgD | glucan biosynthesis protein OpgD |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (15/18); total (15/18) |
TTGAGCCGGTGATTACGCTTTCCAGTGGGGAAGCGAAGCAAATCGAAATTCTCTATATTGAACCCATCGATGGTTATCGTATTCAGTTTGACTGGTATCCGACTTCGGACTCCACTGATCCGGTCGATATGCGGATGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGG > NZ_CP009273/1492527‑1492796 | ttGAGCCGGTGATTACGCTTTCCAGTGGGGAAGCGAAGCAAATCGAAATTCTCTATATTGAACCCATCAATGGTTATCGTATTCAGTTTGACTGGTATCCGACTTCGGACTCCACTGATCCGGTCGATATGCGGGTGTa < 1:16540/139‑1 (MQ=255) cGCTTTCCAGTGGGGAAGCGAAGCAAATCGAAATTCTCTATATTGAACCCATCGATGGTTATCGTATTCAGTTTGACTGGTATCCGACTTCGGACTCCACTGATCCGGTCGATATGCGGGTGTATCTACGTTGTCAgg < 1:96306/138‑1 (MQ=255) ggggAAGCGAAGCAAATCGAAATTCTCTATATTGAACCCATCGATGGTTATCGTATTCAGTTTGACTGGTATCCGACTTCGGACTCCACTGATCCGGTCGATATGCGGGTGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTAt > 2:189825/1‑137 (MQ=255) aagcgaagcAAATCGAAATTCTCTATATTGAACCCATCGATGGTTATCGTATTCAGTTTGACTGGTATCCGACTTCGGACTCCACTGATCCGGTCGATATGCGGGTGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTAt > 2:570980/1‑133 (MQ=255) aagcgaagcAAATCGAAATTCTCTATATTGAACCCATCGATGGTTATCGTATTCAGTTTGACTGGTATCCGACTTCGGACTCCACTGATCCGGTCGATATGCGGGTGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTAt < 1:570980/133‑1 (MQ=255) aagcgaagcAAATCGAAATTCTCTATATTGAACCCATCGATGGTTATCGTATTCAGTTTGACTGGTATCCGACTTCGGACTCCACTGATCCGGTCGATATGCGGGTGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTg > 1:453008/1‑138 (MQ=255) cgaagcAAATCGAAATTCTCTATATTGAACCCATCGATGGTTATCGTATTCAGTTTGACTGGTATCCGACTTCGGACTCCACTGATCCGGTCGATATGCGGGTGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAAc < 2:158446/139‑1 (MQ=255) aagcAAATCGAAATTCTCTATATTGAACCCATCGATGGTTATCGTATTCAGTTTGACTGGTATCCGACTTCGGACTCCACTGATCCGGTCGATATGCGGGTGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACAt < 1:179171/139‑1 (MQ=255) gcAAATCGAAATTCTCTATATTGAACCCATCGATGGTTATCGTATTCAGTTTGACTGGTATCCGACTTCGGACTCCACTGATCCGGTCGATATGCGGGTGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATgg < 1:354245/139‑1 (MQ=255) aaTTCTCTATATTGAACCCATCGATGGTTATCGTATTCAGTTTGACTGGTATCCGACTTCGGACTCCACTGATCCGGTCGATATGCGGGTGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAg < 1:395584/139‑1 (MQ=255) 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gTCGATATGCGGGTGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCAcc > 2:216515/1‑139 (MQ=255) gTCGATATGCGGGTGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCAcc > 1:235875/1‑139 (MQ=255) tatGCGGGTGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACcttctt > 1:394633/1‑139 (MQ=255) cGGGTGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCggg < 2:235875/139‑1 (MQ=255) | TTGAGCCGGTGATTACGCTTTCCAGTGGGGAAGCGAAGCAAATCGAAATTCTCTATATTGAACCCATCGATGGTTATCGTATTCAGTTTGACTGGTATCCGACTTCGGACTCCACTGATCCGGTCGATATGCGGATGTATCTACGTTGTCAGGGGGACGCTATCAGTGAAACATGGCTGTATCAGTATTTCCCGCCAGCGCCGGATAAACGTCAGTATGTTGACGACCGCGTGATGAGTTAATCGTTTTTTCTTCGGCACCTTCTTCGGG > NZ_CP009273/1492527‑1492796 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |