Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 3,005,362 | T→C | G181G (GGT→GGC) | arcC → | carbamate kinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 3,005,362 | 0 | T | C | 100.0% | 85.1 / NA | 24 | G181G (GGT→GGC) | arcC | carbamate kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (7/17); total (7/17) |
AGCAACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCTGGTCGCGGCTATCGCCGTGTTGTTGCCTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCAGGTCAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATAAAGACTGGGCCAGCGCCCGTTTAGCAGAAATGATTGATGCCGATATGCT > NZ_CP009273/3005235‑3005496 | agCAACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCTGGTCGCGGCTATCGCCGTGTTGTTGCCTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCAGGCCAGGTGGTGAt < 1:390930/139‑1 (MQ=255) cAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCTGGTCGCGGCTATCGCCGTGTTGTTGCCTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCAGGCCAGGTGGTGATCACCGTTgg < 1:493297/139‑1 (MQ=255) aaaCAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCTGGTCGCGGCTATCGCCGTGTTGTTGCCTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCAGGCCAGGTGGTGATCACCGTTGGCg < 1:13973/139‑1 (MQ=255) aaCAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCTGGTCGCGGCTATCGCCGTGTTGTTGCCTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCAGGCCAGGTGGTGATCACCGTTGGCgg < 1:273956/139‑1 (MQ=255) aaCAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCTGGTCGCGGCTATCGCCGTGTTGTTGCCTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCAGGCCAGGTGGTGATCACCGTTGGCgg < 1:35199/139‑1 (MQ=255) aTGCTGGTCGCGGCTATCGCCGTGTTGTTGCCTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCAGGCCAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGa < 1:366356/139‑1 (MQ=255) tGCTGGTCGCGGCTATCGCCGTGTTGTTGCCTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCAGGCCAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTg > 1:209964/1‑137 (MQ=255) tCGCGGCTATCGCCGTGTTGTTGCCTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGcaggccag > 1:217597/1‑88 (MQ=255) tCGCGGCTATCGCCGTGTTGTTGCCTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGcaggccag < 2:217597/88‑1 (MQ=255) ggCTATCGCCGTGTTGTTGCCTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCGGGCCAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATc < 1:421103/139‑1 (MQ=255) tCGCCGTGTTGTTGCCTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCAGGCCAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCg < 2:102879/138‑1 (MQ=255) gttgttGCCTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCAGGCCAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGc > 1:299158/1‑137 (MQ=255) tCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCAGGCCAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTa > 2:23913/1‑139 (MQ=255) gCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCAGGCCAGGTGGTGAt < 2:345557/69‑1 (MQ=255) gCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCAGGCCAGGTGGTGAt > 1:345557/1‑69 (MQ=255) gCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCAGGCCAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTCATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTa < 2:299158/137‑1 (MQ=255) gTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCAGGCCAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTa > 1:415557/1‑127 (MQ=255) gTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCAGGCCAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTa < 2:415557/127‑1 (MQ=255) cATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCAGGCCAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATa < 1:218202/125‑1 (MQ=255) cATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCAGGCCAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATa > 2:218202/1‑125 (MQ=255) ggTTAAAGCTCTGGTAGATGCAGGCCAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATAAAGACTGGGCCAGCGCCCGTTTAGCAGaa < 1:30621/139‑1 (MQ=255) gTAGATGCAGGCCAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATAAAGACTGGGCCAGCGCCCGTTTAGCAGAAATGATTGATGCCg < 2:501416/139‑1 (MQ=255) aTGCAGGCCAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATAAAGACTGGGCCAGCGCCCGTTTAGCAGAAATGATTGATGCCGatat < 1:434298/139‑1 (MQ=255) aTGCAGGCCAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATAAAGACTGGGCCAGCGCCCGTTTAGCAGAAATGATTGATGCCGatat < 1:394856/139‑1 (MQ=255) tGCAGGCCAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGAt > 2:373132/1‑91 (MQ=255) tGCAGGCCAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGAt < 1:373132/91‑1 (MQ=255) aggccaggtGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATAAAGACTGGGCCAGCGCCCGTTTAGCAGAAATGATTGATGCCGATATGCt > 1:248827/1‑138 (MQ=255) | AGCAACTGACAAAACAGGGTTACACTCTGAAAGAAGATGCTGGTCGCGGCTATCGCCGTGTTGTTGCCTCGCCAAAACCGGTTGATATCATTGAAAAAGAAACGGTTAAAGCTCTGGTAGATGCAGGTCAGGTGGTGATCACCGTTGGCGGTGGTGGTATCCCTGTTATTCGTGAAGGTAACCATCTGCGTGGTGCCAGCGCGGTTATCGATAAAGACTGGGCCAGCGCCCGTTTAGCAGAAATGATTGATGCCGATATGCT > NZ_CP009273/3005235‑3005496 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |