| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 3,602,485 | A→G | intergenic (‑129/‑92) | tusA ← / → yhhQ | sulfurtransferase TusA/7‑cyano‑7‑deazaguanine/7‑aminomethyl‑7‑ deazaguanine transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 3,602,485 | 0 | A | G | 100.0% | 91.8 / NA | 27 | intergenic (‑129/‑92) | tusA/yhhQ | sulfurtransferase TusA/7‑cyano‑7‑deazaguanine/7‑aminomethyl‑7‑ deazaguanine transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (11/16); total (11/16) | |||||||||||
CGGTCATTTTCTTCTCATCACTTAAAAAAACGGCGCTAGTTTACGCCCTGTGAGTCCGTAAGCAAACTAGGTTAACGATTGCGTGAAAATTAACCATTGCATTGTCAACGTAAAGCAGTATCATGCGGCGGCTCGAAAAAAGGGTAAGCACGTTATTATGTTAAGGTAACAGACGTGTCGTACGTATTGGGTTCCCTCACCCCAATGGTTAATCAAAAAGGTACAATATGAACGTTTTCTCGCAAACTCAACGCTATAAGGCGTTGTTC > NZ_CP009273/3602350‑3602618 | cGGTCATTTTCTTCTCATCACTTAAAAAAACGGCGCTAGTTTACGCCCTGTGAGTCCGTAAGCAAACTAGGTTAACGATTGCGTGAAAATTAACCATTGCATTGTCAACGTAAAGCAGTATCATGCGGCGGCTCGgaa > 2:358465/1‑138 (MQ=255) ggTCATTTTCTTCTCATCACTTAAAAAAACGGCGCTAGTTTACGCCCTGTGAGTCCGTAAGCAAACTAGGTTAACGATTGCGTGAAAATTAACCATTGCATTGTCAACGTAAAGCAGTATCATGCGGCGGCTCGgaaa < 1:99271/138‑1 (MQ=255) ttttCTTCTCATCACTTAAAAAAACGGCGCTAGTTTACGCCCTGTGAGTCCGTAAGCAAACTAGGTTAACGATTGCGTGAAAATTAACCATTGCATTGTCAACGTAAAGCAGTATCATGCGGCGGCTCGGAAAAAGGGt < 2:569405/139‑1 (MQ=255) ttttCTTCTCATCACTTAAAAAAACGGCGCTAGTTTACGCCCTGTGAGTCCGTAAGCAAACTAGGTTAACGATTGCGTGAAAATTAACCATTGCATTGTCAACGTAAAGCAGTATCATGCGGCGGCTCGGAAAAAGGGt < 1:505756/139‑1 (MQ=255) tcttctCATCACTTAAAAAAACGGCGCTAGTTTACGCCCTGTGAGTCCGTAAGCAAACTAGGTTAACGATTGCGTGAAAATTAACCATTGCATTGTCAACGTAAAGCAGTATCATGCGGCGGCTCGGAAAAAGGGTaa < 1:286287/138‑1 (MQ=255) ctcATCACTTAAAAAAACGGCGCTAGTTTACGCCCTGTGAGTCCGTAAGCAAACTAGGTTAACGATTGCGTGAAAATTAACCATTGCATTGTCAACGTAAAGCAGTATCATGCGGCGGCTCGGAAAAAGGGTAAGc < 2:324173/136‑1 (MQ=255) atcaCTTAAAAAAACGGCGCTAGTTTACGCCCTGTGAGTCCGTAAGCAAACTAGGTTAACGATTGCGTGAAAATTAACCATTGCATTGTCAACGTAAAGCAGTATCATGCGGCGGCTCGGAAAAAGGGTAAGCACg < 1:245708/136‑1 (MQ=255) atcaCTTAAAAAAACGGCGCTAGTTTACGCCCTGTGAGTCCGTAAGCAAACTAGGTTAACGATTGCGTGAAAATTAACCATTGCATTGTCAACGTAAAGCAGTATCATGCGGCGGCTCGGAAAAAGGGTAAGCACg > 2:245708/1‑136 (MQ=255) atcaCTTAAAAAAACGGCGCTAGTTTACGCCCTGTGAGTCCGTAAGCAAACTAGGTTAACGATTGCGTGAAAATTAACCATTGCATTGTCAACGTAAAGCAGTATCATGCGGCGGCTCGGAAAAAGGGTAAGCACGtta < 1:581035/139‑1 (MQ=255) aaaaaaaCGGCGCTAGTTTACGCCCTGTGAGTCCGTAAGCAAACTAGGTTAACGATTGCGTGAAAATTAACCATTGCATTGTCAACGTAAAGCAGTATCATGCGGCGGCTCGGAAAAAGGGTAAGCACGTTATTATGt < 1:123424/138‑1 (MQ=255) aaaaaaCGGCGCTAGTTTACGCCCTGTGAGTCCGTAAGCAAACTAGGTTAACGATTGCGTGAAAATTAACCATTGCATTGTCAACGTAAAGCAGTATCATGCGGCGGCTCGGAAAAAGGGTAAGCACGTTATTATGTTa < 1:296573/139‑1 (MQ=255) tgtgAGTCCGTAAGCAAACTAGGTTAACGATTGCGTGAAAATTAACCATTGCATTGTCAACGTAAAGCAGTATCATGCGGCGGCTCGGAAAAAGGGTAAGCACGTTATTATGTTAAGGTAACAGACGTGTCGTACGTAt > 1:497408/1‑139 (MQ=255) tgtgAGTCCGTAAGCAAACTAGGTTAACGATTGCGTGAAAATTAACCATTGCATTGTCAACGTAAAGCAGTATCATGCGGCGGCTCGGAAAAAGGGTAAGCACGTTATTATGTTAAGGTAACAGACGTGTCGTACGTAt > 1:36323/1‑139 (MQ=255) aGTCCGTAAGCAAACTAGGTTAACGATTGCGTGAAAATTAACCATTGCATTGTCAACGTAAAGCAGTATCATGCGGCGGCTCGGAAAAAGGGTAAGCACGTTATTATGTTAAGGTAACAGACGTGTCGTACGTATTgg < 2:349518/138‑1 (MQ=255) tatgCAAACTAGGTTAACGAGTGCGTCAAAATTAACCATTGCATTGTCAACGTAAAGCAGTATCATGCGGCGGCTCGGCAAAAGGGTAAGCACGTCATTATGTTAAGGTAACAGACGTGTCGTACGTATTGGGTTCCCt > 2:165013/4‑139 (MQ=255) gTTAACGATTGCGTGAAAATTAACCATTGCATTGTCACCGTAAAGCAGTATCATGCGGCGGCTCGGAAAAAGGGTAAGCACGTTATTATGTTAAGGTAACAGACGTGTCGTACGTATTGGGTTCCCTCACCCCAATGGt > 1:333566/1‑139 (MQ=255) ttAACGATTGCGTGAAAATTAACCATTGCATTGTCAACGTAAAGCAGTATCATGCGGCGGCTCGGAAAAAGGGTAAGCACGTTATTATGTTAAGGTAACAGACGTGTCGTACGTATTGGGTTCCCTCACCCCAATGGtt < 2:497408/139‑1 (MQ=255) gCGTGAAAATTAACCATTGCATTGTCAACGTAAAGCAGTATCATGCGGCGGCTCGGAAAAAGGGTAAGCACGTTATTATGTTAAGGTAACAGACGTGTCGTACGTATTGGGTTCCCTCACCCCAATGGTTAATCaaaa < 2:352380/138‑1 (MQ=255) cGTGAAAATTAACCATTGCATTGTCAACGTAAAGCAGTATCATGCGGCGGCTCGGAAAAAGGGTAAGCACGTTATTATGTTAAGGTAACAGACGTGTCGTACGTATTGGGTTCCCTCACCCCAATGGTTAATCAAAAAg > 2:368306/1‑139 (MQ=255) aaaaTTAACCATTGCATTGTCAACGTAAAGCAGTATCATGCGGCGGCTCGGAAAAAGGGTAAGCACGTTATTATGTTAAGGTAACAGACGTGTCGTACGTATTGGGTTCCCTCACCCCAATGGTTAATCAAAAAGGTa < 2:338340/138‑1 (MQ=255) cGTAAAGCAGTATCATGCGGCGGCTCGGTAAAAGGGTAAGCACGTTATTATGTTAAGTTAACAGACGTGTCGTACGTATTGGTTTCCCTCACCGCAATGGTTAATCAAAAAGGGACAATATGAACGTTTTCTCGCaac > 2:55374/1‑137 (MQ=255) gTAAAGCAGTATCATGCGGCGGCTCGGAAAAAGGGTAAGCACGTTATTATGTTAAGGTAACAGACGTGTCGTACGTATTGGGTTCCCTCACCCCAATGGTTAATCAAAAAGGTACAATATGAACGTTTTCTCGCAAACt < 2:298059/139‑1 (MQ=255) aTCATGCGGCGGCTCGGAAAAAGGGTAAGCACGTTATTATGTTAAGGTAACAGACGTGTCGTACGTATTggg > 1:122714/1‑72 (MQ=255) aTCATGCGGCGGCTCGGAAAAAGGGTAAGCACGTTATTATGTTAAGGTAACAGACGTGTCGTACGTATTggg < 2:122714/72‑1 (MQ=255) tCATGCGGCGGCTCGGAAAAAGGGTAAGCACGTTATTATGTTAAGGTAACAGACGTGTCGTACGTATTGGGTTCCCTCACCCCAATGGTTAATCAAAAAGGTa > 1:271367/1‑103 (MQ=255) tCATGCGGCGGCTCGGAAAAAGGGTAAGCACGTTATTATGTTAAGGTAACAGACGTGTCGTACGTATTGGGTTCCCTCACCCCAATGGTTAATCAAAAAGGTa < 2:271367/103‑1 (MQ=255) cggcTCGGAAAAAGGGTAAGCACGTTATTATGTTAAGGTAACAGACGTGTCGTACGTATTGGGTTCCCTc < 1:193453/70‑1 (MQ=255) cggcTCGGAAAAAGGGTAAGCACGTTATTATGTTAAGGTAACAGACGTGTCGTACGTATTGGGTTCCCTc > 2:193453/1‑70 (MQ=255) gcTCGGAAAAAGGGTAAGCACGTTATTATGTTAAGGTAACAGACGTGTCGTACGTATTGGGTTCCCTCACCCCAATGGTTAATCAAAAAGGTACAATATGAACGTTTTCTCGCAAACTCAACGCTATAAGGCGTTGTTc > 1:391092/1‑139 (MQ=255) | CGGTCATTTTCTTCTCATCACTTAAAAAAACGGCGCTAGTTTACGCCCTGTGAGTCCGTAAGCAAACTAGGTTAACGATTGCGTGAAAATTAACCATTGCATTGTCAACGTAAAGCAGTATCATGCGGCGGCTCGAAAAAAGGGTAAGCACGTTATTATGTTAAGGTAACAGACGTGTCGTACGTATTGGGTTCCCTCACCCCAATGGTTAATCAAAAAGGTACAATATGAACGTTTTCTCGCAAACTCAACGCTATAAGGCGTTGTTC > NZ_CP009273/3602350‑3602618 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |