Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 4,052,334 | A→G | I190V (ATT→GTT) | typA → | ribosome‑dependent GTPase TypA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 4,052,334 | 0 | A | G | 100.0% | 161.4 / NA | 48 | I190V (ATT→GTT) | typA | ribosome‑dependent GTPase TypA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (26/22); total (26/22) |
TGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACGGTATCGCGGGTCTGGACCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGATTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTACAACAGCTATGTTGGCGTTATCGGCATTGGCCGCATCAAGCGCGGTAAAGTGAAGCCGAAC > NZ_CP009273/4052206‑4052468 | tGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACGGTATCGCGGGTCTGGACCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCa > 2:22832/1‑139 (MQ=255) gTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACGGTATCGCGGGTCTGGACCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCAc > 2:278227/1‑139 (MQ=255) ccTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACGGTATCGCGGGTCTGGACCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTgcg > 1:46025/1‑139 (MQ=255) agcagcTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACGGTATCGCGGGTCTGGACCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGa < 2:370874/139‑1 (MQ=255) cagcTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACGGTATCGCGGGTCTGGACCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACg < 1:568019/139‑1 (MQ=255) cTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACGGTATCGCGGGTCTGGACCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTc < 2:185627/139‑1 (MQ=255) cGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACGGTATCGCGGGTCTGGACCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCa < 2:400118/97‑1 (MQ=255) cGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACGGTATCGCGGGTCTGGACCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCa > 1:400118/1‑97 (MQ=255) cGCTTCTGCGCTGAACGGTATCGCGGGTCTGGACCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTtct < 1:278227/139‑1 (MQ=255) cTGCGCTGAACGGTATCGCGGGTCTGGACCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAg < 2:76407/137‑1 (MQ=255) cTGCGCTGAACGGTATCGCGGGTCTGGACCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGc < 2:531193/138‑1 (MQ=255) cTGCGCTGAACGGTATCGCGGGTCTGGACCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGc < 2:12162/138‑1 (MQ=255) cTGCGCTGAACGGTATCGCGGGTCTGGACCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGc < 2:46025/138‑1 (MQ=255) cTGCGCTGAACGGTATCGCGGGTCTGGACCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGc < 1:312037/138‑1 (MQ=255) aaCGGTATCGCGGGTCTGGGCCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTac > 1:395610/1‑138 (MQ=255) aaCGGTATCGCGGGTCTGGACCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTac > 1:152134/1‑138 (MQ=255) aaCGGTATCGCGGGTCTGGACCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTac < 1:322983/138‑1 (MQ=255) cgGGTCTGGACCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTac < 2:271612/128‑1 (MQ=255) cgGGTCTGGACCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTac > 1:271612/1‑128 (MQ=255) tCTGGACCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTACAACAGCTATGTTGGc > 1:306565/1‑139 (MQ=255) cGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACTTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGa < 2:86151/78‑1 (MQ=255) cGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTgcgc > 1:189472/1‑62 (MQ=255) cGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTgcgc < 2:189472/62‑1 (MQ=255) cGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGa > 1:86151/1‑78 (MQ=255) cGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCCGCTCGATTACAACAGCTATGTTGGCGTTATCgg > 1:333407/1‑138 (MQ=255) cGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGc > 1:571068/1‑107 (MQ=255) cGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGc < 2:571068/107‑1 (MQ=255) cGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTACAACAGCTATGTTGGCGTTATCgg > 1:313272/1‑138 (MQ=255) cGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTACAACAGCTATGTTGGCGTTATCgg > 2:365798/1‑138 (MQ=255) cGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTACAACAGCTATGTTGGCGTTATCgg > 1:318693/1‑138 (MQ=255) cGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTACAACAGCTATGTTGGCGTTATCgg > 1:462702/1‑138 (MQ=255) gAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTACAACAGCTATGTTGGCGTTATCGGCa < 2:229355/139‑1 (MQ=255) gAAGAGATGGCGGAAGACATGTCCCCGCTGTACGAGGCGGTGGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTGCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTACAACAGCTATGTTGGCGTTATCGGCa < 2:150590/139‑1 (MQ=255) atatGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTac > 2:40810/1‑110 (MQ=255) atatGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTac < 1:40810/110‑1 (MQ=255) tatGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTACAACAGCTATGTTGGCGTTATCGGCATTGGc < 1:142795/139‑1 (MQ=255) aGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCt < 1:493556/93‑1 (MQ=255) aGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTACAACAGCTATGTTGGCGTTATCGGCATTGGCCGCATCAAg > 2:32728/1‑139 (MQ=255) aGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGAAGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCt > 2:493556/1‑93 (MQ=255) aCATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTACAACAGCTATGTTGGCGTTATCGGCATTGGCCGCATCAAgcg < 2:306565/139‑1 (MQ=255) aCATGACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTACAACAGCTATGTTGGCGTTATCGGCATTGGCCGCATCAAgcg < 2:152134/139‑1 (MQ=255) gACCCCGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTACAACAGCTATGTTGGCGTTATCGGCATTGGCCGCATCAAGCGCgg > 2:564061/1‑138 (MQ=255) cGCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTAAAACAGCTATGTTGGCGTTATCGGCATTGGCCGCATCAAGCGCGGTAAAGt > 1:220881/1‑139 (MQ=255) gCTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTACAACAGCTATGTTGGCGTTATCGGCATTGGCCGCATCAAGCGCGGTAAAGt > 1:116353/1‑138 (MQ=255) cTGTACCAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTACAACAGCTATGTTGGCGTTATCGGCATTGGCCGCATCAAGCGCGGTAAAGTg > 2:396291/1‑138 (MQ=255) ccAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTACAACAGCTATGTTGGCGTTATCGGCATTGGCCGCATCAAGCGCGGTAAAGTGAAGcc > 1:46424/1‑138 (MQ=255) cAGGCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTACAACAGCTATGTTGGCGTTATCGGCATTGGCCGCATCAAGCGCGGTAAAGTGAAGCCg > 2:153007/1‑138 (MQ=255) ggCGGTTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTACAACAGCTATGTTGGCGTTATCGGCATTGGCCGCATCAAGCGCGGTAAAGTGAAGCCGAAc > 2:556604/1‑139 (MQ=255) | TGTTCGTTAACCTCGACGCGACCGACGAGCAGCTGGACTTCCCGATCGTTTACGCTTCTGCGCTGAACGGTATCGCGGGTCTGGACCACGAAGATATGGCGGAAGACATGACCCCGCTGTACCAGGCGATTGTTGACCACGTTCCTGCGCCGGACGTTGACCTTGACGGTCCGTTCCAGATGCAGATTTCTCAGCTCGATTACAACAGCTATGTTGGCGTTATCGGCATTGGCCGCATCAAGCGCGGTAAAGTGAAGCCGAAC > NZ_CP009273/4052206‑4052468 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |