Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 4,409,650 | T→C | intergenic (‑208/‑147) | ulaG ← / → ulaA | L‑ascorbate 6‑phosphate lactonase/PTS ascorbate transporter subunit IIC |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 4,409,650 | 0 | T | C | 100.0% | 57.2 / NA | 17 | intergenic (‑208/‑147) | ulaG/ulaA | L‑ascorbate 6‑phosphate lactonase/PTS ascorbate transporter subunit IIC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (8/9); total (8/9) |
TTCAGGAAGGCAATGACCATTTTTTGACTTTTTGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTC > NZ_CP009273/4409515‑4409779 | ttCAGGAAGGCAATGACCATTTTTTGACTTTTTGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAAccc < 2:409624/138‑1 (MQ=255) gCAATGACCATTTTTTGACTTTTTGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAACCCCACTCTATcc < 1:416778/139‑1 (MQ=255) gggAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAACCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTca > 2:43886/1‑138 (MQ=255) aaGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAACCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACAtt < 2:157022/139‑1 (MQ=255) gttgttgATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAACCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAAt < 2:360563/138‑1 (MQ=255) gttgATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAACCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCat > 2:196566/1‑138 (MQ=255) gATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAACCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCataaa < 2:247526/138‑1 (MQ=255) aTGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAACCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGa < 1:370020/139‑1 (MQ=255) tgtgTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAACCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAAt > 2:24583/1‑137 (MQ=255) ttAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAACCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGcac < 1:241145/139‑1 (MQ=255) ttAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAACCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGca > 2:452171/1‑138 (MQ=255) aCTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAACCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCacaa < 1:43886/138‑1 (MQ=255) aTGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAACCCCACTCTATcc > 2:295360/1‑48 (MQ=255) aTGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAACCCCACTCTATcc < 1:295360/48‑1 (MQ=255) tCGTTGTGTGAACCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTAc > 1:21936/1‑139 (MQ=255) ttGTGTGAACCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACctc > 1:384386/1‑139 (MQ=255) tgtgAACCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCggg < 1:461226/38‑1 (MQ=255) tgtgAACCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCggg > 2:461226/1‑38 (MQ=255) | TTCAGGAAGGCAATGACCATTTTTTGACTTTTTGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTC > NZ_CP009273/4409515‑4409779 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |