Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 675,373 | A→G | E137G (GAA→GGA) | ybeU → | DUF1266 domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 675,373 | 0 | A | G | 100.0% | 105.3 / NA | 30 | E137G (GAA→GGA) | ybeU | DUF1266 domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (16/14); total (16/14) |
TTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAA > NZ_CP009273/675249‑675502 | ttGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTAt < 2:176928/139‑1 (MQ=255) ttGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTAt > 1:577064/1‑139 (MQ=255) gATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATgg > 1:488616/1‑139 (MQ=255) ttCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATcgcgcg > 1:527095/1‑139 (MQ=255) cccAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGt < 2:457445/139‑1 (MQ=255) cTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCa > 2:286544/1‑139 (MQ=255) tATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCAc > 2:541340/1‑139 (MQ=255) tgtgCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCAcc < 2:488616/138‑1 (MQ=255) tgCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCAtt < 1:428257/139‑1 (MQ=255) aaGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAg < 1:467286/120‑1 (MQ=255) aaGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAg > 2:467286/1‑120 (MQ=255) aaGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAg > 1:532086/1‑139 (MQ=255) aaGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAg > 1:399276/1‑139 (MQ=255) ggggAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTg > 2:372044/1‑139 (MQ=255) aaTCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATg < 2:491647/139‑1 (MQ=255) cAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCAc > 2:219366/1‑139 (MQ=255) aaTGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGt > 2:341618/1‑137 (MQ=255) aTGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAg < 2:577064/139‑1 (MQ=255) aTGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAg < 2:277573/139‑1 (MQ=255) aTGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAg < 2:224993/139‑1 (MQ=255) gTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAAt > 2:537320/1‑139 (MQ=255) tgCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTtctc < 1:6008/138‑1 (MQ=255) tgCTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTtctc < 1:286544/138‑1 (MQ=255) cTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTAc < 2:189682/123‑1 (MQ=255) cTCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTAc > 1:189682/1‑123 (MQ=255) tCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCt > 1:563029/1‑51 (MQ=255) tCAACAAGTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCt < 2:563029/51‑1 (MQ=255) gTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTTCGAg < 2:561806/53‑1 (MQ=255) gTGGCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAg > 1:561806/1‑53 (MQ=255) gCTGACGGGAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGacaa > 2:18729/1‑138 (MQ=255) | TTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGGACGTCTCTACTGGCAATCTTCTCAGTGCGAAGACAA > NZ_CP009273/675249‑675502 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |