| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 1,124,635 | T→C | R447R (CGT→CGC) | murJ → | murein biosynthesis integral membrane protein MurJ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 1,124,635 | 0 | T | C | 100.0% | 88.1 / NA | 26 | R447R (CGT→CGC) | murJ | murein biosynthesis integral membrane protein MurJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (13/13); total (13/13) | |||||||||||
TTGAAACATGCCGGGCTGTCACTTTCTATTGGTCTGGCGGCGTGTCTGAATGCTTCGCTGCTTTACTGGCAGTTGCGTAAGCAGAAAATCTTTACCCCGCAACCCGGCTGGATGGCGTTTCTGTTGCGTCTGGTGGTGGCGGTACTGGTGATGTCTGGCGTGCTTTTAGGTATGTTACATATCATGCCGGAGTGGTCATTGGGTACCATGCCCTGGCGTTTACTGCGTTTAATGGCGGTCGTGCTGGCGGGGATTGCCGCG > NZ_CP009273/1124507‑1124767 | ttGAAACATGCCGGGCTGTCACTTTCTATTGGTCTGGCGGCGTGTCTGAATGCTTCGCTGCTTTACTGGCAGTTGCGTAAGCAGAAAATCTTTACCCCGCAACCCGGCTGGATGGCGTTTCTGTTGCGCCtggtggtgg < 2:488584/139‑1 (MQ=255)ttGAAACATGCCGGGCTGTCACTTTCTATTGGTCTGGCGGCGTGTCTGAATGCTTCGCTGCTTTACTGGCAGTTGCGTAAGCAGAAAATCTTTACCCCGCAACCCGGCTGGATGGCGTTTCTGTTGCGCCtggtggtgg < 2:207603/139‑1 (MQ=255) gAAACATGCCGGGCTGTCACTTTCTATTGGTCTGGCGGCGTGTCTGAATGCTTCGCTGCTTTACTGGCAGTTGCGTAAGCAGAAAATCTTTACCCCGCAACCCGGCTGGATGGCGTTTCTGTTGCGCCTGGTGGTGGc < 1:332819/138‑1 (MQ=255) tGCCGGGCTGTCACTTTCTATTGGTCTGGCGGCGTGTCTGAATGCTTCGCTGCTTTACTGGCAGTTGCGTAAGCAGAAAATCTTTACCCCGCAACCCGGCTGGATGGCGTTTCTGTTGCGCCTGGTGGTGGCGGTACTg > 2:310198/1‑139 (MQ=255) gTCTGGCGGCGTGTCTGAATGCTTCGCTGCTTTACTGGCAGTTGCGTAAGCAGAAAATCTTTACCCCGCAACCCGGCTGGATGGCGTTTCTGTTGCGCCTGGTGGTGGCGGTACTGGTGATGTCTGGCGTGCTTTTAg < 1:411080/138‑1 (MQ=255) tCTGGCGGCGTGTCTGAATGCTTCGCTGCTTTACTGGCAGTTGCGTAAGCAGAAAATCTTTACCCCGCAACCCGGCTGGATGGCGTTTCTGTTGCGCCTGGTGGTGGCGGTACTGGTGATGTCTGGCGTGCTTTTAGGt < 2:198560/139‑1 (MQ=255) ggcgTGTCTGAATGCTTCGCTGCTTTACTGGCAGTTGCGTAAGCAGAAAATCTTTACCCCGCAACCCGGCTGGATGGCGTTTCTGTTGCGCCTGGTGGTGGCGGTACTGGTGATGTCTGGCGTGCTTTTAGGTATGTTa < 1:310198/139‑1 (MQ=255) ttCGCTGCTTTACTGGCAGTTGCGTAAGCAGAAAATCTTTACCCCGCAACCCGGCTGGATGGCGTTTCTGTTGCGCCtggtggtgg > 2:249522/1‑86 (MQ=255) ttCGCTGCTTTACTGGCAGTTGCGTAAGCAGAAAATCTTTACCCCGCAACCCGGCTGGATGGCGTTTCTGTTGCGCCtggtggtgg < 1:249522/86‑1 (MQ=255) cGCTGCTTTACTGGCAGTTGCGTAAGCAGAAAATCTTTACCCCGCAACCCGGCTGGATGGCGTTTCTGTTGCGCCTGGTGGTGGCGGTACTGGTGATGTCTGGCGTGCTTTTAGGTATGTTACATACCATGCCggtgcg > 2:122511/1‑135 (MQ=255) tgctTTACTGGCAGTTGCGTAAGCAGAAAATCTTTACCCCGCAACCCGGCTGGATGGCGTTTCTGTTGCGCCTGGTGGTGGCGGTACTGGTGATGTCTGGCGTGCTTTTAGGTATGTTACATATCATGCCGGAGTGGt > 1:159113/1‑138 (MQ=255) gCAGTTGCGTAAGCAGAAAATCTTTACCCCGCAACCCGGCTGGATGGCGTTTCTGTTGCGCCTGGTGGTGGCGGTACTGGTGATGTCTGGCGTGCTTTTAGGTATGTTACATATCATGCCGGAGTGGTCATTGGGTAc > 1:49120/1‑138 (MQ=255) gCAGTTGCGTAAGCAGAAAATCTTTACCCCGCAACCCGGCTGGATGGCGTTTCTGTTGCGCCTGGTGGTGGCGGGACTGGTGATGTCTGGCGTGCTTTTAGGTATGTTACATATCATGCCGGAGTGGTCATTGGGTAcc > 2:428452/1‑139 (MQ=255) aGTTGCGTAAGCAGAAAATCTTTACCCCGCAACCCGGCTGGATGGCGTTTCTGTTGCGCCTGGTGGTGGCGGTACTGGTGATGTCTGGCGTGCTTTTAGGTATGTTACATATCATGCCGGAGTGGTCATTGGGTACCa > 1:454280/1‑138 (MQ=255) aGTTGCGTAAGCAGAAAATCTTTACCCCGCAACCCGGCTGGATGGCGTTTCTGTTGCGCCTGGTGGTGGCGGTACTGGTGATGTCTGGCGTGCTTTTAGGTATGTTACATATCATGCCGGAGTGGTCATTGGGTACCa < 2:454280/138‑1 (MQ=255) aGTTGCGTAAGCAGAAAATCTTTACCCCGCAACCCGGCTGGATGGCGTTTCTGTTGCGCCTGGTGGTGGCGGTACTGGTGATGTCTGGCGTGCTTTTAGGGATGTTACATATCATGCCGGAGTGGTCATTGGGTACCAt > 2:1894/1‑139 (MQ=255) gCGTAAGCAGAAAATCTTTACCCCGCAACCCGGCTGGATGGCGTTTCTGTTGCGCCTGGTGGTGGCGGTACTGGTGATGTCTGGCGTGCTTTTAGGTATGTTACATATCATGCCGGAGTGGTCATTGGGTACCATGcc < 2:159113/138‑1 (MQ=255) tAAGCAGAAAATCTTTACCCCGCAACCCGGCTGGATGGCGTTTCTGTTGCGCCtggt > 1:214441/1‑57 (MQ=255) tAAGCAGAAAATCTTTACCCCGCAACCCGGCTGGATGGCGTTTCTGTTGCGCCtggt < 2:214441/57‑1 (MQ=255) tACCCCGCAACCCGGCTGGATGGCGTTTCTGTTGCGCCTGGTGGTGGCGGTACTGGTGATGTCTGGCGTGCTTTTAGGTATGTTACATATCATGCCGGAGTGGTCATTGGGTACCATGcc < 1:466997/120‑1 (MQ=255) tACCCCGCAACCCGGCTGGATGGCGTTTCTGTTGCGCCTGGTGGTGGCGGTACTGGTGATGTCTGGCGTGCTTTTAGGTATGTTACATATCATGCCGGAGTGGTCATTGGGTACCATGcc > 2:466997/1‑120 (MQ=255) cAACCCGGCTGGATGGCGTTTCTGTTGCGCCTGGTGGTGGCGGTACTGGTGATGTCTGGCGTGCTTTTAGGTATGTTACATATCATGCCGGAGTGGTCATTGGGTACCATGCCCTGGCGTTTACTGCGTTTAATGGCgg > 2:21212/1‑139 (MQ=255) cAACCCGGCTGGATGGCGTTTCTGTTGCGCCTGGTGGTGGCGGAACTGGTGATGTCTGGCGTGCTTTTAGGTATGTTACATATCATGCCGGAGTGGTCATTGGGTACCATGCCCTGGCGTTTACTGCGTTTAATGGCgg > 2:87926/1‑139 (MQ=255) ggCTGGATGGCGTTTCTGTTGCGCCTGGTGGTGGCGGTACTGGTGATGTCTGGCGTGCTTTTAGGTATGTTACATATCATGCCGGAGTGGTCATTGGGTACCATGCCCTGGCGTTTACTGCGTTTAATGGCgg < 2:222435/133‑1 (MQ=255) ggCTGGATGGCGTTTCTGTTGCGCCTGGTGGCGGCGGTACTGGTGATGTCTGGCGTGCTTTTAGGTATGTTACATATCATGCCGGAGTGGTCATTGGGTACCATGCCCTGGCGTTTACTGCGTTTAATGGCgg > 1:222435/1‑133 (MQ=255) ttGCGCCTGGTGGTGGCGGTACTGGTGATGTCTGGCGTGCTTTTAGGTATGTTACATATCATGCCGGAGTGGTCATTGGGTACCATGCCCTGGCGTTTACTGCGTTTAATGGCGGTCGTGCTGGCGGGGATTGCcgcg < 1:233053/138‑1 (MQ=255) | TTGAAACATGCCGGGCTGTCACTTTCTATTGGTCTGGCGGCGTGTCTGAATGCTTCGCTGCTTTACTGGCAGTTGCGTAAGCAGAAAATCTTTACCCCGCAACCCGGCTGGATGGCGTTTCTGTTGCGTCTGGTGGTGGCGGTACTGGTGATGTCTGGCGTGCTTTTAGGTATGTTACATATCATGCCGGAGTGGTCATTGGGTACCATGCCCTGGCGTTTACTGCGTTTAATGGCGGTCGTGCTGGCGGGGATTGCCGCG > NZ_CP009273/1124507‑1124767 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |