Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	2778555	2778573	19	2 [0]	[1] 4	BW25113_RS25705/BW25113_RS13825	DUF5507 domain‑containing protein/tRNA‑Ile

TTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGA  >  NZ_CP009273/2778472‑2778554                                                                                   | ttCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGa  <  1:575016/83‑1 (MQ=255) ttCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGa  >  2:575016/1‑83 (MQ=255)                                                                                   | TTCACTTGCTACGCATGGAACTTTTAATTAAATTAGCACAGGAATGTTAAATTTAATAAACAAAAGGTTATTTCGCTGTATGA  >  NZ_CP009273/2778472‑2778554

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑