Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	3448830	3448903	74	3 [1]	[0] 2	gspA/gspC	type II secretion system protein GspA/type II secretion system protein GspC

TTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATA  >  NZ_CP009273/3448740‑3448839                                                                                          |           ttctcttctcGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACat            <  1:539641/90‑1 (MQ=255) ttctcttctcGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACat            <  2:149350/90‑1 (MQ=255)           gTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAata  <  2:472007/90‑1 (MQ=255)                                                                                          |           TTCTCTTCTCGTAGACATAGAACTTCCTGTTTTAATTATTGATTATCCTTAATCATAAAAATAATGTATGTATTTATTAATTAAATACATATTACTAATA  >  NZ_CP009273/3448740‑3448839

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑