Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	3798196	3798240	45	3 [1]	[1] 3	rfaS	LPS core biosynthesis protein RfaS

TTTATTAACAACACTGTCATTAATGATAATTATGTCATCTTTTTTAATATCATTGAGGTAATGCTTGATGAATAATCGCCCCAGCCATGC  >  NZ_CP009273/3798240‑3798329  |                                                                                         tttATTAACAACACTGTCATTAATGATAATTATGTCATCTTTTTTAATATCATTGAGGTAATGCTTGATGAATAATCGCCCCAGCCATGc  >  2:80179/1‑90 (MQ=255)  ttattaACAACACTGTCATTAATGATAATTATGTCATCTTTTTTAATATCATTGAGGTAATGCTTGATGAATAATCGCCCCAGCCa     >  1:275452/1‑86 (MQ=255)  ttattaACAACACTGTCATTAATGATAATTATGTCATCTTTTTTAATATCATTGAGGTAATGCTTGATGAATAATCGCCCCAGCCa     <  2:275452/86‑1 (MQ=255)  |                                                                                         TTTATTAACAACACTGTCATTAATGATAATTATGTCATCTTTTTTAATATCATTGAGGTAATGCTTGATGAATAATCGCCCCAGCCATGC  >  NZ_CP009273/3798240‑3798329

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑