Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	4302908	4302954	47	2 [1]	[1] 2	alsR/rpiB	als operon DNA‑binding transcriptional repressor AlsR/bifunctional allose‑6‑phosphate isomerase/ribose‑5‑phosphate isomerase RpiB

ATTTAATTAGTTTAAAAACATGATGTTATTTGTTTTTCTGGTTTTTTAGATGATAGATGTTGCTGGATGGTGAGTGTCTTTAACGCTATTGCGC  >  NZ_CP009273/4302951‑4303044     |                                                                                          aTTTAATTAGTTTAAAAACATGATGTTATTTGTTTTTCTGGTTTTTTAGATGATAGATGTTGCTGGATGGTGAGTGTCTTTAACGCTAtt      >  1:43800/1‑90 (MQ=255)     aaTTAGTTTAAAAACATGATGTTATTTGTTTTTCTGGTTTTTTAGATGATAGATGTTGCTGGATGGTGAGTGTCTTTAACGCTATTgcgc  <  2:489185/90‑1 (MQ=255)     |                                                                                          ATTTAATTAGTTTAAAAACATGATGTTATTTGTTTTTCTGGTTTTTTAGATGATAGATGTTGCTGGATGGTGAGTGTCTTTAACGCTATTGCGC  >  NZ_CP009273/4302951‑4303044

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑