Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	3830063	3830128	66	2 [1]	[1] 3	BW25113_RS26245/setC	virulence RhuM family protein/sugar efflux transporter

TTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGC  >  NZ_CP009273/3830114‑3830203                |                                                                           ttACTATAATTTATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGc  >  1:176454/1‑90 (MQ=255)                tataAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGc                     >  1:550039/1‑56 (MQ=255)                tataAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGc                     <  2:550039/56‑1 (MQ=255)                |                                                                           TTACTATAATTAATATATAAATTCGGTAATTAATTCTTAACATGCTTTTACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGC  >  NZ_CP009273/3830114‑3830203

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑