Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	767319	767329	11	6 [0]	[0] 5	cydA	cytochrome ubiquinol oxidase subunit I

CTCGAATCCACCTTTGTAGGTCTGTTCTTCTTCGGTTGGGATCGTCTGGGTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTC  >  NZ_CP009273/767229‑767318                                                                                          | cTCGAATCCACCTTTGTAGGTCTGTTCTTCTTCGGTTGGGATCGTCTGGGTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTc  <  2:425054/90‑1 (MQ=255) cTCGAATCCACCTTTGTAGGTCTGTTCTTCTTCGGTTGGGATAGTCTGGGTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTc  <  1:182863/90‑1 (MQ=255)                               ttcGGTTGGGATCGTCTGGGTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTc  >  1:137559/1‑60 (MQ=255)                               ttcGGTTGGGATCGTCTGGGTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTc  >  1:89394/1‑60 (MQ=255)                               ttcGGTTGGGATCGTCTGGGTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTc  <  2:137559/60‑1 (MQ=255)                               ttcGGTTGGGATCGTCTGGGTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTc  <  2:89394/60‑1 (MQ=255)                                                                                          | CTCGAATCCACCTTTGTAGGTCTGTTCTTCTTCGGTTGGGATCGTCTGGGTAAAGTTCAGCATATGTGTGTCACCTGGCTGGTGGCGCTC  >  NZ_CP009273/767229‑767318

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑