Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	1459470	1459491	22	3 [1]	[2] 4	[BW25113_RS25580]	[BW25113_RS25580]

TTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACAC  >  NZ_CP009273/1459382‑1459471                                                                                        |   ttatttGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATacac  <  2:339166/90‑1 (MQ=255)  tatttGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATac    >  1:405217/1‑87 (MQ=255)  tatttGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATac    <  2:405217/87‑1 (MQ=255)                                                                                        |   TTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACAC  >  NZ_CP009273/1459382‑1459471

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑