Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	578688	578716	29	4 [2]	[2] 3	BW25113_RS26085/appY	tail fiber assembly protein/DNA‑binding transcriptional activator AppY

AATTGATTTTCAATATCGTTTAATAAAGAAAAATTAAGCAAGCTGGATGTTGGTTTTTTGTTAATTGAATGGTTCTAATAATGTTTTTTTACTGTTGTTGAATGT  >  NZ_CP009273/578702‑578806                |                                                                                          aaTTGATTTTCAATATCGTTTAATAAAGAAAAATTAAGCAAGCTGGATGTTGGTTTTTTGTTAATTGAATGGTTCTAATAATGttttttt                 >  1:99584/1‑90 (MQ=255) aaTTGATTTTCAATATCGTTTAATAAAGAAAAATTAAGCAAGCTGGATGTTGGTTTTTTGTTAATTGAATGGTTCTAATAATGttttttt                 >  2:178858/1‑90 (MQ=255)                tCGTTTAATAAAGAAAAATTAAGCAAGCTGGATGTTGGTTTTTTGTTAATTGAATGGTTCTAATAATGTTTTTTTACTGTTGTTGAAtgt  >  1:640590/1‑90 (MQ=255)                |                                                                                          AATTGATTTTCAATATCGTTTAATAAAGAAAAATTAAGCAAGCTGGATGTTGGTTTTTTGTTAATTGAATGGTTCTAATAATGTTTTTTTACTGTTGTTGAATGT  >  NZ_CP009273/578702‑578806

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑