Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	578792	578804	13	2 [0]	[0] 3	BW25113_RS26085/appY	tail fiber assembly protein/DNA‑binding transcriptional activator AppY

AATTGATTTTCAATATCGTTTAATAAAGAAAAATTAAGCAAGCTGGATGTTGGTTTTTTGTTAATTGAATGGTTCTAATAATGTTTTTTT  >  NZ_CP009273/578702‑578791                                                                                          | aaTTGATTTTCAATATCGTTTAATAAAGAAAAATTAAGCAAGCTGGATGTTGGTTTTTTGTTAATTGAATGGTTCTAATAATGttttttt  <  2:345829/90‑1 (MQ=255) aaTTGATTTTCAATATCGTTTAATAAAGAAAAATTAAGCAAGCTGGATGTTGGTTTTTTGTTAATTGAATGGTTCTAATAATGttttttt  <  2:3540/90‑1 (MQ=255)                                                                                          | AATTGATTTTCAATATCGTTTAATAAAGAAAAATTAAGCAAGCTGGATGTTGGTTTTTTGTTAATTGAATGGTTCTAATAATGTTTTTTT  >  NZ_CP009273/578702‑578791

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑