Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	1674378	1674388	11	5 [1]	[1] 2	ydgI	amino acid permease

GCGACACTGGCAAAATTGTTGCCGCTGGGTCTGTTTGTTGTGCTGGCGATGATGATGTTCAAACTGGATACCTTCAAGCTCGACTTCACCG  >  NZ_CP009273/1674288‑1674378                                                                                          |  gCGACACTGGCAAAATTGTTGCCGCTGGGTCTGTTTGTTGTGCTGGCGATGATGATGTTCAAACTGGATACCTTCAAGCTCGACTTCAcc   <  1:473633/90‑1 (MQ=255) gCGACACTGGCAAAATTGTTGCCGCTGGGTCTGTTTGTTGTGCTGGCGATGATGATGTTCAAACTGGATACCTTCAAGCTCGACTTCAcc   <  2:119053/90‑1 (MQ=255) gCGACACTGGCAAAATTGTTGCCGCTGGGTCTGTTTGTTGTGCTGGCGATGATGATGTTCAAACTGGATACCTTCAAGCTCGACTTCAcc   <  2:92859/90‑1 (MQ=255) gCGACAATGGCAAAATTGTTGCCGCTGGGTCTGTTTGTTGTGCTGGCGATGATCATGTTCAACCTGGATACCTTCAAGCTCGACTTCAcc   <  2:457397/90‑1 (MQ=255)  cGACACTGGCAAAATTGTTGCCGCTGGGTCTGTTTGTTGTGCTGGCGATGATGATGTTCAAACTGGATACCTTCAAGCTCGACTTCACCg  >  1:318609/1‑90 (MQ=255)                                                                                          |  GCGACACTGGCAAAATTGTTGCCGCTGGGTCTGTTTGTTGTGCTGGCGATGATGATGTTCAAACTGGATACCTTCAAGCTCGACTTCACCG  >  NZ_CP009273/1674288‑1674378

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑