Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	1428658	1428673	16	3 [1]	[1] 2	[BW25113_RS25575]	[BW25113_RS25575]

GGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGT  >  NZ_CP009273/1428570‑1428659                                                                                        |   ggTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGt  <  2:232953/90‑1 (MQ=255)                                    gCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCt    <  1:317032/53‑1 (MQ=255)                                    gCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCt    >  2:317032/1‑53 (MQ=255)                                                                                        |   GGTTATTGGATATGCCAATCCCTAATTTTATTAGAGCATGACTAAAAATGCTGAATATGATAAGGAGCGAAGTGATTATCAGTATGCTGT  >  NZ_CP009273/1428570‑1428659

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑