| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP009273 | 331139 = | 85 (3.110) | 4 (0.150) | 3/160 | 2.2 | 4.6% | coding (149/606 nt) | yahD | ankyrin repeat domain‑containing protein |
| ? | NZ_CP009273 | 331150 = | 85 (3.260) | coding (160/606 nt) | yahD | ankyrin repeat domain‑containing protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AAGTAAAAACCTGCCTTGCGCTGGGTGTCGATATTAATACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATCCTTTTTTAATTAGC > NZ_CP009273/331052‑331227 | aaGTAAAAACCTGCCTTGCGCTGGGTGTCGATATTAATACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGc > 1:525354/1‑90 (MQ=255)aaGTAAAAACCTGCCTTGCGCTGGGTGTCGATATTAATACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGc < 2:462233/90‑1 (MQ=255)aaGTAAAAACCTGCCTTGCGCTGGGTGTCGATATTAATACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGc < 1:285828/90‑1 (MQ=255) tAAAAACCTGCCTTGCGCTGGGTGTCGATATTAATACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAat < 2:209328/90‑1 (MQ=255) ccTGCCTTGCGCTGGGTGTCGATATTAATACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCtt < 2:240071/90‑1 (MQ=255) ccTGCCTTGCGCTGGGTGTCGATATTAATACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCtt < 2:299342/90‑1 (MQ=255) gCCTTGCGCTGGGTGTCGATATTAATACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCg > 1:155568/1‑90 (MQ=255) gCCTTGCGCTGGGTGTCGATATTAATACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCg > 2:723320/1‑90 (MQ=255) gCCTTGCGCTGGGTGTCGATATTAATACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCg > 1:459246/1‑90 (MQ=255) gCCTTGCGCTGGGTGTCGATATTAATACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCg > 2:515394/1‑90 (MQ=255) cTTGCGCTGGGTGTCGATATTAATACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGtt > 1:574417/1‑90 (MQ=255) ttGCGCTGGGTGTCGATATTAATACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGtcc < 2:15344/90‑3 (MQ=255) ttGCGCTGGGTGTCGATATTAATACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTc < 1:288100/90‑1 (MQ=255) ttGCGCTGGGTGTCGATATTAATACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTc < 2:781963/90‑1 (MQ=255) ttGCGCTGGGTGTCGATATTAATACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTc < 2:663604/90‑1 (MQ=255) ttGCGCTGGGTGTCGATATTAATACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTc < 1:723320/90‑1 (MQ=255) tGCGCTGGGTGTCGATATTAATACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCa < 1:559175/90‑1 (MQ=255) aggcTGGGTGTCGATATTAATACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAg < 2:49910/88‑1 (MQ=255) gggTGTCGATATTAATACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCAtt > 2:756772/1‑90 (MQ=255) gtCGATATTAATACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACAGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAAtt < 2:223366/90‑1 (MQ=255) gATATTAATACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGAt < 1:330140/90‑1 (MQ=255) atTAATACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGc < 1:408781/58‑1 (MQ=255) atTAATACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGc > 2:408781/1‑58 (MQ=255) atTAATACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGcc > 2:92325/1‑90 (MQ=255) ttAATACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCg > 2:304210/1‑90 (MQ=255) tAATACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCgg > 1:229070/1‑90 (MQ=255) aTACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAg > 2:488881/1‑90 (MQ=255) tACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGc < 1:29568/90‑1 (MQ=255) tACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGc < 2:168866/90‑1 (MQ=255) aCCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCg < 2:318349/90‑1 (MQ=255) aCCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCg < 2:59911/90‑1 (MQ=255) aCCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCg < 1:148407/90‑1 (MQ=255) cTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAg < 2:440554/67‑1 (MQ=255) cTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAg > 1:440554/1‑67 (MQ=255) cTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGa > 2:136251/1‑90 (MQ=255) cTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGa > 1:294207/1‑90 (MQ=255) cTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGa > 1:423805/1‑90 (MQ=255) tGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAg > 2:539599/1‑66 (MQ=255) tGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAg < 1:539599/66‑1 (MQ=255) tGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGat > 1:164099/1‑90 (MQ=255) tGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGat > 2:668469/1‑90 (MQ=255) tGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGat > 1:221757/1‑90 (MQ=255) tGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGat < 2:341444/90‑1 (MQ=255) gCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCa > 2:76920/1‑46 (MQ=255) gCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCa < 1:76920/46‑1 (MQ=255) gCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAg > 1:623337/1‑65 (MQ=255) gCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAg < 2:623337/65‑1 (MQ=255) gCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGata > 1:162227/1‑90 (MQ=255) gCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGata > 2:727767/1‑90 (MQ=255) gCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGata < 1:263127/90‑1 (MQ=255) gATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATAtt > 1:502010/1‑90 (MQ=255) tCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATtaa < 1:108591/90‑1 (MQ=255) tCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATtaa < 1:442377/90‑1 (MQ=255) tCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATtaa < 2:632604/90‑1 (MQ=255) cGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATtaat < 2:154617/90‑1 (MQ=255) gTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATtaata < 1:349213/90‑1 (MQ=255) aGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGc < 1:562199/90‑1 (MQ=255) ggggAAAACGGTAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCa < 2:669032/90‑1 (MQ=255) ggggAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCa < 2:502010/90‑1 (MQ=255) ggggAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCa < 2:650085/90‑1 (MQ=255) ggggAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCa < 1:766044/90‑1 (MQ=255) ggggAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCa < 2:338251/90‑1 (MQ=255) ggggAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCa < 2:778873/90‑1 (MQ=255) ggggAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCa < 1:499191/90‑1 (MQ=255) ggggAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCa < 1:303537/90‑1 (MQ=255) ggggAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCa < 2:491163/90‑1 (MQ=255) ggggAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCa < 1:340941/90‑1 (MQ=255) ggggAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCa < 2:459246/90‑1 (MQ=255) ggggAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCa < 2:162766/90‑1 (MQ=255) ggggAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCa < 2:392373/90‑1 (MQ=255) gggAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCaa > 1:193963/1‑90 (MQ=255) gAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGa > 2:332353/1‑90 (MQ=255) gAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGa > 1:635374/1‑90 (MQ=255) aaaCGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATc > 2:160403/1‑90 (MQ=255) gCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATAcc < 1:488881/90‑1 (MQ=255) gCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATAcc < 2:283589/90‑1 (MQ=255) gCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATAcc < 2:525354/90‑1 (MQ=255) cAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCt < 2:391178/90‑1 (MQ=255) gCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTaaa > 2:88396/1‑90 (MQ=255) aaGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCGGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATCCttt < 1:641704/90‑1 (MQ=255) aaGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATCCttt < 1:542928/90‑1 (MQ=255) aaGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATCCttt < 1:88396/90‑1 (MQ=255) aaGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATCCttt < 1:515394/90‑1 (MQ=255) gTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATCCttttt < 1:427242/90‑1 (MQ=255) cAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATCCTTTTTTAATTAGc < 2:675885/90‑1 (MQ=255) | AAGTAAAAACCTGCCTTGCGCTGGGTGTCGATATTAATACCTGCGATCGTCAGGGGAAAACGGCAATTACGCTGGCAAGTTTATATCAGCAATATGCTTGCGTTCAGGCATTAATTGATGCCGGAGCGGATATTAATAAGCAAGATCATACCTGTTTAAATCCTTTTTTAATTAGC > NZ_CP009273/331052‑331227 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |