| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NZ_CP009273 | 3,631,242 | Δ66 bp | coding (241‑306/1500 nt) | pitA → | inorganic phosphate transporter PitA |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NZ_CP009273 | 3631242 | 3631307 | 66 | 45 [0] | [1] 46 | pitA | inorganic phosphate transporter PitA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP009273 | = 3631241 | 0 (0.000) | 38 (1.910) | 26/156 | 0.0 | 100% | coding (240/1500 nt) | pitA | inorganic phosphate transporter PitA |
| ? | NZ_CP009273 | 3631308 = | 0 (0.000) | coding (307/1500 nt) | pitA | inorganic phosphate transporter PitA | |||||
CGTGGTTATGGCGGCGGTATTCAACTTTTTGGGTGTTTTGCTGGGTGGTCTGAGTGTTGCCTATGCCATTGTGCATATGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NZ_CP009273/3631160‑3631241‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgctgGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCATCCAGCTCTCATACGCTGATTGGCGCGATCATCGGGATTG > NZ_CP009273/3631308‑3631395 CGTGGTTATGGCGGCGGTATTCAACTTTTTGGGTGTTTTGCTGGGTGGTCTGAGTGTTGCCTATGCCATTGTGCATATGCTGGCGGCGAT < 2:49044/90‑1CGTGGTTATGGCGGCGGTATTCAACTTTTTGGGTGTTTTGATGGGTGGTCTGAGTGTTGCCTATGCCATTGTGCATATGCTGGCGGCGAT < 2:558120/90‑1 TGGCGGCGGTATTCAACTTTTTGGGTGTTTTGCTGGGTGGTCTGAGTGTTGCCTATGCCATTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGA < 2:357419/90‑1 TGGCGGCGGTATTCAACTTTTTGGGTGTTTTGCTGGGTGGTCTGAGTGTTGCCTATGCCATTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGA < 2:193285/90‑1 GGCGGCGGTATTCAACTTTTTGGGTGTTTTGCTGGGTGGTCTGAGTGTTGCCTATGCCATTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAA < 1:141444/90‑1 GCGGTATTCAACTTTTTGGGGGTTTTGCTGGGTGGTCTGAGTGTTGCCTATGCCATTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTG > 2:379775/1‑90 GGTATTCAACTTTTTGGGTGTTTTGCTGGGTGGTCTGAGTGTTGCCTATGCCATTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGG < 2:28080/90‑1 TTTTGGGTGTTTTGCTGGGTGGTCTGAGTGTTGCCTATGCCATTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACT < 2:80066/90‑1 TTTTGGGTGTTTTGCTGGGTGGTCTGAGTGTTGCCTATGCCATTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACT > 1:615421/1‑90 TTGGGTGTTTTGCTGGGTGGTCTGAGTGTTGCCTATGCCATTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTT > 1:323938/1‑90 TTGGGTGTTTTGCTGGGTGGTCTGAGTGTTGCCTATGCCATTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTT > 2:348280/1‑90 GTGTTTTGCTGGGTGGTCTGAGTGTTGCCTATGCCATTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTT < 1:237327/90‑1 TGTTTTGCTGGGTGGTCTGAGTGTTGCCTATGCCATTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTT < 2:511087/90‑1 GTTTTGCTGGGTGGTCTGAGTGTTGCCTATGCCATTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTA > 2:16161/1‑90 TTTGCTGGGTGGTCTGAGTGTTGCCTATGCCATTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACC < 2:13337/90‑1 TGCTGGGTGGTCTGAGTGTTGCCTATGCCATTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTG < 1:201826/90‑1 CTGGGTGGTCTGAGTGTTGCCTATGCCATTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCA < 2:445239/90‑1 GGGTGGTCTGAGTGTTGCCTATGCCATTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCATC > 1:18568/1‑90 GGTCTGAGTGTTGCCTATGCCATTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCATCCAGC < 1:379775/90‑1 GAGTGTTGCCTATGCCATTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCATCCAGCTCTCA < 2:427011/90‑1 gGCCTATGCCATTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGGACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCATCCAGCTCTCATACGCT > 1:361955/2‑90 TGCCTATGCCATTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCATCCAGCTCTCATACGCT > 2:66037/1‑90 TGCCTATGCCATTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCATCCAGC > 2:519271/1‑79 TGCCTATGCCATTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCATCCAGC < 1:519271/79‑1 CCTATGCCATTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCATCCAGCTCTCATACGCTGA > 2:534985/1‑90 TATGCCATTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCATCCAGCTCTCATACGCTGATT > 2:226572/1‑90 TGCCATTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCATCCAGCTCTCATACGCTGATTGG > 1:378073/1‑90 TTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCATCCAGCTCTCATACGCTGATTGGCGCca < 2:378073/90‑3 TTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCATCCAGCTCTCATACGCTGATTGGCGCGA > 2:591036/1‑90 TTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCATCCAGCTCTCATACGCTGATTGGCGCGA > 2:67745/1‑90 TTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCATCCAGCTCTCATACGCTGATTGGCGCGA > 2:377144/1‑90 TTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGG < 2:332022/37‑1 TTGTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGG > 1:332022/1‑37 GTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCATCCAGCTCTCATACGCTGATTGGCGCGATC > 1:290140/1‑90 GTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCT < 2:307128/40‑1 GTGCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCT > 1:307128/1‑40 GCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCATCCAGCTCTCATACGCTGATTGGCGCGATCAT < 1:16161/90‑1 GCATATGCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCATCCAGCTCTCATACGCTGATTGGCGCGATCAT > 2:82955/1‑90 GCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCATCCAGCTCTCATACGCTGATTGGCGCGATCATCGGGAT < 2:308253/90‑1 GCTGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCATCCAGCTCTCATACGCTGATTGGCGCGATCATCGGGAT < 1:33065/90‑1 TGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCATCCAGCTCTCATACGCTGATTGGCGCGATCATCGGGATTG > 2:48660/1‑90 TGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCATCCAGCTCTCATACGCTGATTGGCGCGATCATCGGGATTG > 1:106097/1‑90 TGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCATCCAGCTCTCATACGCTGATTGGCGCGATCATCGGGATTG > 1:267543/1‑90 TGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCATCCAGCTC < 2:292457/58‑1 TGGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCATCCAGCTC > 1:292457/1‑58 CGTGGTTATGGCGGCGGTATTCAACTTTTTGGGTGTTTTGCTGGGTGGTCTGAGTGTTGCCTATGCCATTGTGCATATGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NZ_CP009273/3631160‑3631241‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgctgGCGGCGATTATCTGGAACCTGGGTACCTGGTACTTTGGTTTACCTGCATCCAGCTCTCATACGCTGATTGGCGCGATCATCGGGATTG > NZ_CP009273/3631308‑3631395 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |