Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ NZ_CP009273 3629063 3646524–3645396 16334–17462 119 [2] [8] 9 [yhiM]–BW25113_RS18160 [yhiM],yhiN,pitA,uspB,uspA,BW25113_RS26225,BW25113_RS26230,dtpB,rsmJ,prlC,rlmJ,gorA,dinQ,arsR,arsB,arsC,BW25113_RS18155,BW25113_RS18160

AAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTGACACTATTTTTTTACAT  >  NZ_CP009273/3646508‑3646614
                 |                                                                                         
aaGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTg                   >  1:1466931/1‑90 (MQ=31)
 aGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTGa                  <  2:250229/90‑1 (MQ=32)
     gatgaCTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTGACACt              <  2:383923/90‑1 (MQ=38)
       tgaCTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTGACACTAt            >  2:1541894/1‑90 (MQ=39)
            cATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTGACACTAtttttt       >  1:1487247/1‑90 (MQ=255)
              tgatgaACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTGACACTATTTTTTTa     <  2:982079/90‑1 (MQ=255)
                atgaACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTGACACTATTTTTTTACa   <  1:827338/90‑1 (MQ=255)
                atgaACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTGACACTATTTTTTTACa   <  2:593335/90‑1 (MQ=255)
                 tgaACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTGACACTATTTTTTTACAt  <  2:907714/90‑1 (MQ=255)
                 |                                                                                         
AAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGGTGACACTATTTTTTTACAT  >  NZ_CP009273/3646508‑3646614

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: