New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NZ_CP009273 | 4321902 = | 104 (1.520) | 4 (0.070) | 4/140 | 3.8 | 4.4% | intergenic (+81/‑31) | proP/pmrR | glycine betaine/L‑proline transporter ProP/LpxT activity modulator PmrR |
? | NZ_CP009273 | 4321930 = | 83 (1.380) | intergenic (+109/‑3) | proP/pmrR | glycine betaine/L‑proline transporter ProP/LpxT activity modulator PmrR | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
GATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGC > NZ_CP009273/4321813‑4321989 | gatgaATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATa > 2:1949748/1‑90 (MQ=255) gaATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATActc < 1:1653732/90‑1 (MQ=255) gaATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATActc < 2:2114020/90‑1 (MQ=255) aaTAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATActct < 1:798445/90‑1 (MQ=255) aaTAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATActct < 1:1238724/90‑1 (MQ=255) aaTAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATActct < 1:855774/90‑1 (MQ=255) tAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTctcc > 1:861535/1‑90 (MQ=255) tAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTctcc > 1:179372/1‑90 (MQ=255) aGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTctcctc > 1:280195/1‑90 (MQ=255) aGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTctcctc > 2:803337/1‑90 (MQ=255) gCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCtcctcc < 1:76917/90‑1 (MQ=255) gCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCtcctcc < 1:1530801/90‑1 (MQ=255) cTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGTCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCa > 2:1924264/1‑90 (MQ=255) aaCGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGtt < 1:1233439/90‑1 (MQ=255) aaCGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGtt < 1:393200/90‑1 (MQ=255) aaCGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGtt < 2:280195/90‑1 (MQ=255) aaCGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGtt < 1:1705412/90‑1 (MQ=255) cGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTaa < 2:1301939/90‑1 (MQ=255) cGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTaa > 2:89016/1‑90 (MQ=255) ggATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAAc > 2:1099854/1‑90 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACgg < 1:832614/90‑1 (MQ=255) aTGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACgg < 1:89016/90‑1 (MQ=255) gCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACggagg > 2:2117830/1‑90 (MQ=255) tGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGgaga > 2:1382276/1‑90 (MQ=255) gATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACggagga < 1:1528569/87‑1 (MQ=255) gATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACggagga > 2:1528569/1‑87 (MQ=255) aTGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGgaggag > 1:1678065/1‑87 (MQ=255) aTGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGgaggag < 2:1678065/87‑1 (MQ=255) gtgACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGc < 1:1949748/90‑1 (MQ=255) tgACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCa < 1:1382276/90‑1 (MQ=255) gACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCaa < 2:1249599/90‑1 (MQ=255) gACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCaa > 1:1803272/1‑90 (MQ=255) gACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACCCGCATACTCTCCTCCAGGtt > 2:868762/1‑73 (MQ=255) gACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACCCGCATACTCTCCTCCAGGtt < 1:868762/73‑1 (MQ=255) aCGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAAt > 1:1050451/1‑90 (MQ=255) aCGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAAt > 1:142728/1‑90 (MQ=255) tGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGaaa > 2:221867/1‑90 (MQ=255) tGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGaaa > 1:60127/1‑90 (MQ=255) tGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGaaa > 1:743484/1‑90 (MQ=255) gTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGaaaa > 1:1485926/1‑90 (MQ=255) gTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGaaaa > 1:1255378/1‑90 (MQ=255) cTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAAc < 1:313267/90‑1 (MQ=255) tATCAGGCCAATTTAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCg < 1:1518041/90‑1 (MQ=255) tCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCgtg < 1:2100243/90‑1 (MQ=255) aGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGtt > 1:731493/1‑90 (MQ=255) gCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTa > 1:273327/1‑90 (MQ=255) gCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTa > 1:286769/1‑90 (MQ=255) gCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTa > 2:1692956/1‑90 (MQ=255) gCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTa > 2:2007125/1‑90 (MQ=255) cAATTGGACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCg > 1:1567779/1‑82 (MQ=255) cAATTGGACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCg < 2:1567779/82‑1 (MQ=255) aaTTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGa < 1:598068/90‑1 (MQ=255) aaTTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGa < 1:1337389/90‑1 (MQ=255) aTTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCtcctcc < 1:1225216/48‑1 (MQ=255) aTTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCtcctcc > 2:1225216/1‑48 (MQ=255) aTTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCgtgt < 2:185187/83‑1 (MQ=255) aTTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCgtgt > 1:185187/1‑83 (MQ=255) aTTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGaa > 2:634416/1‑90 (MQ=255) aTTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGa < 1:951374/89‑1 (MQ=255) ttGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGaaa < 1:858903/90‑1 (MQ=255) gAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGt < 2:1803272/90‑1 (MQ=255) gAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGt < 1:221867/90‑1 (MQ=255) gAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGt < 2:1082526/90‑1 (MQ=255) aCTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGtt < 1:2143360/48‑1 (MQ=255) aCTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGtt > 2:746120/1‑48 (MQ=255) aCTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGtt > 2:2143361/1‑48 (MQ=255) aCTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGt < 1:1391285/61‑1 (MQ=255) aCTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGt > 2:1391285/1‑61 (MQ=255) aCTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGttt > 2:1654021/1‑90 (MQ=255) ctctTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGGGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTa > 1:197978/1‑90 (MQ=255) ctTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAAc < 1:108406/90‑1 (MQ=255) ctTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAAc < 1:462915/90‑1 (MQ=255) ctTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAAc < 1:1999783/90‑1 (MQ=255) ctTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAAc < 2:835073/90‑1 (MQ=255) ctTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCATGTTTATGAAAGTTTAAc < 2:1435476/90‑1 (MQ=255) tAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTa < 1:2007125/90‑1 (MQ=255) aaGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTAc < 2:60127/90‑1 (MQ=255) ggTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCg < 1:1692956/90‑1 (MQ=255) ttCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCgtg < 1:2071108/67‑1 (MQ=255) ttCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCgtg > 2:2071108/1‑67 (MQ=255) tCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGgaggag < 2:1965911/47‑1 (MQ=255) tCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGgaggag > 1:1965911/1‑47 (MQ=255) tCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAAc < 1:1935437/82‑1 (MQ=255) tCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAAc > 2:1935437/1‑82 (MQ=255) tCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCgtgt > 1:1892058/1‑90 (MQ=255) tCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCgtgt > 1:41136/1‑90 (MQ=255) aCTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGaaa > 2:1210737/1‑73 (MQ=255) aCTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGaaa < 1:1210737/73‑1 (MQ=255) aCTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAAc < 2:347495/80‑1 (MQ=255) aCTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAAc > 1:347495/1‑80 (MQ=255) tctcTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGaa > 1:1081161/1‑66 (MQ=255) tctcTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGaa < 2:1081161/66‑1 (MQ=255) tctGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCt < 1:2117830/90‑1 (MQ=255) ctGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCtg > 2:323480/1‑90 (MQ=255) ctGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCtg > 2:339420/1‑90 (MQ=255) ctGACGCCCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCtg > 1:1316838/1‑90 (MQ=255) gACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCtggt > 2:1937193/1‑90 (MQ=255) cgcATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTc < 2:273327/90‑1 (MQ=255) gcATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTca > 1:1415472/1‑90 (MQ=255) aTACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTcagc < 2:861535/90‑1 (MQ=255) | GATGAATAAGCTGAAACGGATGGCCTGATGTGACGCTGTCTTATCAGGCCAATTGAACTCTTAAGGTTCACTTAATCTCTGACGCGCATACTCTCCTCCAGGTTAACGGAGGAGAGTGCAATGAAAAACCGTGTTTATGAAAGTTTAACTACCGTGTTCAGCGTGCTGGTGGTCAGC > NZ_CP009273/4321813‑4321989 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |