Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	1325771	1325781	11	5 [1]	[0] 2	topA	type I DNA topoisomerase

TGATTGGGGGTGATGATGCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAG  >  NZ_CP009273/1325681‑1325772                                                                                          |   tGATTGGGGGTGATGATGCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTg    <  1:250784/90‑1 (MQ=255) tGATTGGGGGTGATGATGCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTg    <  1:4086/90‑1 (MQ=255) tGATTGGGGGTGATGATGCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTg    <  2:175984/90‑1 (MQ=255) tGATTGGGGGTGATGATGCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTg    <  2:61404/90‑1 (MQ=255)   aTTGGGGGTGATGATGCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAg  <  2:3536/90‑1 (MQ=255)                                                                                          |   TGATTGGGGGTGATGATGCGCGCTATAGCCGAGTGGTGTTTAACGAAATTACTAAAAACGCGATCCGCCAGGCATTTAACAAACCGGGTGAG  >  NZ_CP009273/1325681‑1325772

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑