Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	4465872	4465894	23	2 [1]	[0] 5	BW25113_RS22080	hypothetical protein

GGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACA  >  NZ_CP009273/4465895‑4465984 |                                                                                          ggggTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAAt                                              >  1:288357/1‑46 (MQ=255) ggggTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAAt                                              <  2:288357/46‑1 (MQ=255) ggggTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAAt          >  1:248067/1‑82 (MQ=255) ggggTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAAt          <  2:248067/82‑1 (MQ=255) ggggTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCcaca  >  1:113944/1‑90 (MQ=255) |                                                                                          GGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACA  >  NZ_CP009273/4465895‑4465984

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑