Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	4531470	4531525	56	3 [1]	[0] 4	fimB/fimE	type 1 fimbria switch DNA invertase FimB/type 1 fimbria switch DNA invertase FimE

TAGTTGAGATACCAGGGATGGTGTTAAAAACTACATTATTCTTACGATATATCAAAAATGATTAACCATTTATTAATTGATGTTATTGTAAGTGTGATTCTTAATTATCATAATAAACATTAAGTTA  >  NZ_CP009273/4531380‑4531506                                                                                          |                                      tAGTTGAGATACCAGGGATGGTGTTAAAAACTACATTATTCTTACGATATATCAAAAATGATTAACCATTTATTAATTGATGTTATTGTa                                       <  1:129154/90‑1 (MQ=255) tAGTTGAGATACCAGGGATGGTGTTAAAAACTACATTATTCTTACGATATATCAAAAATGATTAACCATTTATTAATTGATGTTATTGTa                                       <  2:299854/90‑1 (MQ=255)                                      attCTTACGATATATCAAAAATGATTAACCATTTATTAATTGATGTTATTGTAAGTGTGATTCTTAATTATCATAATAAACATTAAGTTa  >  1:304302/1‑90 (MQ=255)                                                                                          |                                      TAGTTGAGATACCAGGGATGGTGTTAAAAACTACATTATTCTTACGATATATCAAAAATGATTAACCATTTATTAATTGATGTTATTGTAAGTGTGATTCTTAATTATCATAATAAACATTAAGTTA  >  NZ_CP009273/4531380‑4531506

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑