Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	4302864	4302913	50	2 [1]	[1] 3	alsR/rpiB	als operon DNA‑binding transcriptional repressor AlsR/bifunctional allose‑6‑phosphate isomerase/ribose‑5‑phosphate isomerase RpiB

AGTTTATTTTATTGTGAACAATGGCGAGTGGCTTAAAATTTTATTTCATTTAATTAGTTTAAAAACATGATGTTATTTGTTTTTCTGGTTTTTTAG  >  NZ_CP009273/4302904‑4302999           |                                                                                      aGTTTATTTTATTGTGAACAATGGCGAGTGGCTTAAAATTTTATTTCATTTAATTAGTTTAAAAACATGATGTTATTTGTTTTTCTGGtt        >  1:113715/1‑90 (MQ=255)           attGTGAACAATGGCGAGTGGCTTAAAATTTTATTTCATTTAATTAGTTTAAAAACATGATGTTATTTGTTTTTCTGGTTTTTTAg  <  1:186710/86‑1 (MQ=255)           attGTGAACAATGGCGAGTGGCTTAAAATTTTATTTCATTTAATTAGTTTAAAAACATGATGTTATTTGTTTTTCTGGTTTTTTAg  >  2:186710/1‑86 (MQ=255)           |                                                                                      AGTTTATTTTATTGTGAACAATGGCGAGTGGCTTAAAATTTTATTTCATTTAATTAGTTTAAAAACATGATGTTATTTGTTTTTCTGGTTTTTTAG  >  NZ_CP009273/4302904‑4302999

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑