Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	4241422	4241432	11	4 [1]	[0] 2	BW25113_RS20970	SopA family protein

GACAGCTGTTATGTTTGATTATGTGCGAATGTCGACAGGGAATTTTAAAGATTGCATTACAGAACAATTGGAATTAACTATTGATTATTCAGATA  >  NZ_CP009273/4241332‑4241426                                                                                          |      gACAGCTGTTATGTTTGATTATGTGCGAATGTCGACTGGGAATTTTAAAGATTGCATTACAGAACAATTGGAATTAACTATTGATTATTc       <  1:284602/90‑1 (MQ=255)      cTGTTATGTTTGATTATGTGCGAATGTCGACAGGGAATTTTAAAGATTGCATTACAGAACAATTGGAATTAACTATTGATTATTCAGata  <  1:77587/90‑1 (MQ=255)                            aaTGTCGACAGGGAATTTTAAAGATTGCATTACAGAACAATTGGAATTAACTATTGATTATTc       <  1:7008/63‑1 (MQ=255)                            aaTGTCGACAGGGAATTTTAAAGATTGCATTACAGAACAATTGGAATTAACTATTGATTATTc       >  2:7008/1‑63 (MQ=255)                                                                                          |      GACAGCTGTTATGTTTGATTATGTGCGAATGTCGACAGGGAATTTTAAAGATTGCATTACAGAACAATTGGAATTAACTATTGATTATTCAGATA  >  NZ_CP009273/4241332‑4241426

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑