Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 454,444 | A→G | E34G (GAA→GGA) | lon → | endopeptidase La |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 454,444 | 0 | A | G | 100.0% | 131.9 / NA | 37 | E34G (GAA→GGA) | lon | endopeptidase La |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (21/16); total (21/16) |
GTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGAAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGGACCATGATAAAAAAATTATGCTGGTCGCGCAGAAAGAAGCTTCAACGGATGA > NZ_CP009273/454357‑454528 | gTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGgaa < 1:539974/90‑1 (MQ=255) ttCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCTGGCGGGgaaa > 1:176470/1‑90 (MQ=255) gCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGGAAAATCTATcc < 2:141001/90‑1 (MQ=255) cATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCg > 1:1009697/1‑90 (MQ=255) aTTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCGt < 2:567307/90‑1 (MQ=255) cccGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCGTTGTCTGGaa < 1:252436/90‑1 (MQ=255) cGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAgc < 2:510991/90‑1 (MQ=255) cGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAgc < 1:450219/90‑1 (MQ=255) gCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCGTTGTCTGGaa < 1:555398/82‑1 (MQ=255) gCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCGTTGTATGGaa > 2:555398/1‑82 (MQ=255) cGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATgg > 2:18834/1‑90 (MQ=255) cTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGGAc < 2:282461/90‑1 (MQ=255) tGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGGAcc < 1:202616/90‑1 (MQ=255) tGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGGAcc > 1:785811/1‑90 (MQ=255) tGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGGAcc > 2:888573/1‑90 (MQ=255) gcgcGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCTTTGTCTGGAAGCGGCGATGGACCa > 2:740947/1‑90 (MQ=255) ttATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGgaa < 1:707788/41‑1 (MQ=255) ttATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGgaa > 2:707788/1‑41 (MQ=255) ttATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAgc > 2:999840/1‑63 (MQ=255) ttATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAgc < 1:999840/63‑1 (MQ=255) ttATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGAt > 1:989487/1‑69 (MQ=255) ttATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGAt < 2:989487/69‑1 (MQ=255) ttATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGGACCATGATaaa < 1:617982/82‑1 (MQ=255) ttATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGGACCATGATaaa > 2:617982/1‑82 (MQ=255) ttATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGGACCATGATAAAAAAATTAt > 1:640050/1‑90 (MQ=255) aTCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCGt > 2:910248/1‑50 (MQ=255) aTCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCGt < 1:910248/50‑1 (MQ=255) aTCCCCTTATTTGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGGACCATGATAAAAAAATTATGCTGGTCGCGCagaaa > 1:506519/1‑90 (MQ=255) tCCCCTTATTTGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGGACCATGATAAAAAAATTATGCTGGTcg < 1:157400/81‑1 (MQ=255) tCCCCTTATTTGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGGACCATGATAAAAAAATTATGCTGGTcg > 2:157400/1‑81 (MQ=255) cTTATTTGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGGACCATGATAAAAAAATTATGCTGGTCGCGCAGAAAGAAGc > 2:305891/1‑90 (MQ=255) ttATTTGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGGACCATGATAAAAAAATTATGCTGGTCGCGCAGAAAGAAGCt < 1:948788/90‑1 (MQ=255) tGTCGGTCGGGGAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGGACCATGATAAAAAAATTATGCTGGTCGCGCAGAAAGAAGCTTCAAc > 1:984842/1‑90 (MQ=255) tGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGGACCATGATAAAAAAATTATGCTGGTCGCGCAGAAAGAAGCTTCAAc > 2:356041/1‑90 (MQ=255) tGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGGACCATGATAAAAAAATTATGCTGGTCGCGCAGAAAGAAGCTTCAAc > 1:404481/1‑90 (MQ=255) tGTCGGGCGGGGAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGGACCATGATAAAAAAATTATGCTGGTCGAGCAGAAAGAAGCTTCAAc < 2:640050/90‑1 (MQ=255) tCGGGCGGGGAAAAACTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGTTGGACCATGATAAAAAAATTATGCTGGCCGCGCAGAAAGAAGCTTCAACgg > 2:833537/1‑90 (MQ=255) cgggcgggGAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGGACCATGATAAAAAAATTATGCTGGTCGCGCAGAAAGAAGCTTCAACGGa > 2:859888/1‑90 (MQ=255) gggcgggGAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGGACCATGATAAAAAAATTATGCTGGTCGCGCAGAAAGAAGCTTCAGCGGAt > 2:1067166/1‑90 (MQ=255) gggcgggGAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGGACCATGATAAAAAAATTATGCTGGTCGCGCAGAAAGAAGCTTCAACGGAt < 2:619032/90‑1 (MQ=255) gcgggGAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGGACCATGATAAAAAAATTATGCTGGTCGCGCAGAAAGAAGCTTCAACGGATGa > 1:347372/1‑90 (MQ=255) | GTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGAAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGGACCATGATAAAAAAATTATGCTGGTCGCGCAGAAAGAAGCTTCAACGGATGA > NZ_CP009273/454357‑454528 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |