| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 797,607 | A→C | T89P (ACC→CCC) | ybhI → | anion permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 797,607 | 0 | A | C | 100.0% | 50.9 / NA | 16 | T89P (ACC→CCC) | ybhI | anion permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (11/5); total (11/5) | |||||||||||
GTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCT > NZ_CP009273/797523‑797689 | gTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTcccacc > 1:380056/1‑90 (MQ=255) ccTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTCCCACctggctgg > 1:103821/1‑90 (MQ=255) cAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTCCCACCTGGCTGgtgt > 1:130655/1‑90 (MQ=255) ggtggtggtggtTACCTTCCCCGGGGGTG‑GTTTAAAACCCCCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTCCCACCTGGCTGGTGTtctc < 2:117795/90‑1 (MQ=255) tggtggtCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTCCCACCTGGCTGGTGTTCTCgg > 1:583669/1‑90 (MQ=255) tggtcgtCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTCCCACCTGGCTGGTGTTCTCgg > 1:692194/1‑90 (MQ=255) tggtCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTCCCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGt > 2:924632/1‑90 (MQ=255) ggtCGGTACCTTCTCCGGCGGGGCTTTAAAAC‑CCCCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTCCCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGtt < 2:162974/90‑1 (MQ=255) ggtCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTCCCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGtt > 1:355150/1‑90 (MQ=255) gTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTCCCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTAccc > 1:117795/1‑89 (MQ=255) ggTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTCCCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCAttt > 1:781941/1‑90 (MQ=255) cccccgccgTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTCCCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGtt < 2:180836/87‑1 (MQ=255) accGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTCCCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTa > 1:464480/1‑90 (MQ=255) cgTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTCCCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTaa < 2:380056/90‑1 (MQ=255) aGCGGTTACTCTTCAGGTCCCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGAATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTAtt < 2:284820/90‑1 (MQ=255) tACTCTTCAGGTCCCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTAt > 2:404383/1‑90 (MQ=255) ttCAGGTCCCACCTGGCTGGGGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATctgct > 2:47602/1‑90 (MQ=255) | GTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAA‑CCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCT > NZ_CP009273/797523‑797689 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |