| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 1,764,071 | A→G | L247L (TTA→TTG) | ydiK → | AI‑2E family transporter YdiK |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 1,764,071 | 0 | A | G | 100.0% | 69.4 / NA | 20 | L247L (TTA→TTG) | ydiK | AI‑2E family transporter YdiK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (10/10); total (10/10) | |||||||||||
GTGACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCGATACC > NZ_CP009273/1763988‑1764155 | gtgACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTGATGATc > 1:226587/1‑90 (MQ=255)gtgACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTGATGATc < 2:705058/90‑1 (MQ=255)gtgACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTGATGATc > 1:382259/1‑90 (MQ=255)gtgACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTGATGATc > 1:737689/1‑90 (MQ=255) tgACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTGATGATcc > 1:383939/1‑90 (MQ=255) tgACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTGATGATcc < 1:872647/90‑1 (MQ=255) gTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTGATGATCCTCTCCTGCCTTGTcc > 1:1032301/1‑85 (MQ=255) gTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTGATGATCCTCTCCTGCCTTGTcc < 2:1032301/85‑1 (MQ=255) tGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCATATGCAACGTTGCTAACGGTGTTGATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTg > 1:153601/1‑90 (MQ=255) aTCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTGATGATc < 2:364578/57‑1 (MQ=255) aTCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTGATGATc > 1:364578/1‑57 (MQ=255) cGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTGATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGAt > 1:465755/1‑90 (MQ=255) tCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTGATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCg < 2:383939/90‑1 (MQ=255) cTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTGATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGc < 2:49194/90‑1 (MQ=255) ttATGCAACGTTGCTAACGGTGTTGATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGct > 2:511223/1‑90 (MQ=255) gTTGCTAACGGTGTTGATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGATCTactggac < 2:465755/90‑1 (MQ=255) gCTAACGGTGTTGATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTactggactgg < 2:164416/90‑1 (MQ=255) cGGTGTTGATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCGATa < 1:511223/90‑1 (MQ=255) cGGTGTTGATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCGATa < 2:226587/90‑1 (MQ=255) gtgtTGATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGACCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCGATacc > 2:874804/1‑90 (MQ=255) | GTGACGGCGTTAGTACAGGCAGTGCTTGGCGGTATCGGCCTCGCCGTATCCGGCGTACCTTATGCAACGTTGCTAACGGTGTTAATGATCCTCTCCTGCCTTGTCCAGCTTGGCCCGTTGCCGGTACTGATTCCGGCGATTATCTGGCTCTACTGGACTGGCGATACC > NZ_CP009273/1763988‑1764155 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |