Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	2083875	2083959	85	3 [0]	[1] 5	hisG	ATP phosphoribosyltransferase

CTGCGTCGTCTGGATTTCGGCGGCTGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACG  >  NZ_CP009273/2083958‑2084049   |                                                                                          cTGCGTCGTCTGGATTTCGGCGGCTGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTaaa    >  1:222630/1‑90 (MQ=255)   gCGTCGTCTGGATTTCGGCGGCTGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAAc          >  1:333068/1‑82 (MQ=255)   gCGTCGTCTGGATTTCGGCGGCTGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAAc          <  2:333068/82‑1 (MQ=255)   gCGTCGTCTGGATTTCGGCGGCTGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACg  >  1:38775/1‑90 (MQ=255)   gCGTCGTCTGGATTTCGGCGGCTGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACg  >  2:179885/1‑90 (MQ=255)   |                                                                                          CTGCGTCGTCTGGATTTCGGCGGCTGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACG  >  NZ_CP009273/2083958‑2084049

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑