Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	578977	579061	85	4 [1]	[1] 2	BW25113_RS26085/appY	tail fiber assembly protein/DNA‑binding transcriptional activator AppY

TCCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGC  >  NZ_CP009273/579060‑579151   |                                                                                          tcCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGttt    >  2:15443/1‑90 (MQ=255)   cTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGc  <  1:340234/90‑1 (MQ=255)   |                                                                                          TCCTGATTATGATTGTGTATTTAATTGGTTGTTATTTGACTACTATCAACTTGTTTTAATTTTATGATAGGTGCAAGATGGATTATGTTTGC  >  NZ_CP009273/579060‑579151

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑