Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	1194004	1194033	30	2 [1]	[1] 3	BW25113_RS05920/lit	hypothetical protein/cell death peptidase Lit

AATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAAT  >  NZ_CP009273/1193914‑1194011                                                                                          |         aatgatgaaatgatgaaatgacgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCtt          <  1:240993/90‑1 (MQ=255)         aatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaaatgatgaCAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAAt  >  2:121179/1‑90 (MQ=255)                                                                                          |         AATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGAAATGATGACAGAGTGTCCAGTGGGCACGGATGGTGTCTTACGACATGCTTACCTTAAT  >  NZ_CP009273/1193914‑1194011

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑