Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	1138114	1138125	12	3 [1]	[1] 5	rne	ribonuclease E

CGCTTCTGCTTTCGGTGCTGGTTGCTCGGTCGGTTTGGTTTCTTCACCACCGCTGAACAGCGCTTTCAGTGCGCCGAAGAAGCGGCTCAACA  >  NZ_CP009273/1138024‑1138115                                                                                          |   cGCTTCTGCTTTCGGTGCTGGTTGCTCGGTCGGTTTGGTTTCTTCACCACCGCTGAACAGCGCTTTCAGTGCGCCGAAGAAGCGGCTCaa    <  1:33538/90‑1 (MQ=255) cGCTTCTGCTTTCGGTGCTGGTTGCTCGGTCGGTTTGGTTTCTTCACCACCGCTGAACAGCGCTTTCAGTGCGCCGAAGAAGCGGCTCaa    <  2:136455/90‑1 (MQ=255)   cTTCTGCTTTCGGTGCTGGTTGCTCGGTCGGTTTGGTTTCTTCACCACCGCTGAACAGCGCTTTCAGTGCGCCGAAGAAGCGGCTCAACa  <  1:7987/90‑1 (MQ=255)                                                                                          |   CGCTTCTGCTTTCGGTGCTGGTTGCTCGGTCGGTTTGGTTTCTTCACCACCGCTGAACAGCGCTTTCAGTGCGCCGAAGAAGCGGCTCAACA  >  NZ_CP009273/1138024‑1138115

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑