Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	1700492	1700564	73	3 [1]	[1] 2	rsxA	electron transport complex subunit RsxA

TGCGTTAATTACCGCAGGTCTTATGTCTCTGGCCTTTATGGGCTTTAGTGGTTTGGTGAAGTTGTAATGAATGCTATCTGGATTGCCGTTGCCGCCGTGAGCCTGCTGGGCCTGGC  >  NZ_CP009273/1700539‑1700654                           |                                                                                          tGCGTTAATTACCGCAGGTCTTATGTCTCTGGCCTTTATGGGCTTTAGTGGTTTGGTGAAGTTGTAATGAATGCTATCTGGAttgccgtt                            >  2:54648/1‑90 (MQ=255)                           ctctGGCCTTTATGGGCTTTAGTGGTTTGGTGAAGTTGTAATGAATGCTATCTGGATTGCCGTTGCCGCCGTGAGCCTGCTGGGCCTGGc  >  1:86892/1‑90 (MQ=255)                           |                                                                                          TGCGTTAATTACCGCAGGTCTTATGTCTCTGGCCTTTATGGGCTTTAGTGGTTTGGTGAAGTTGTAATGAATGCTATCTGGATTGCCGTTGCCGCCGTGAGCCTGCTGGGCCTGGC  >  NZ_CP009273/1700539‑1700654

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑