Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	565859	565860	2	3 [0]	[0] 3	ybcK	recombinase family protein

GTTGATGGTGAGATTTATTTCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGA  >  NZ_CP009273/565861‑565950 |                                                                                          gTTGATGGTGAGATTTATTTCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGAc                    <  1:27492/72‑1 (MQ=255) gTTGATGGTGAGATTTATTTCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGAc                    >  2:27492/1‑72 (MQ=255) gTTGATGGTGAGATTTATTTCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGa  >  2:177133/1‑90 (MQ=255) |                                                                                          GTTGATGGTGAGATTTATTTCTAAATAATGATCTCGGATTTTAAGTTATGCTATGGTGATAAAGTGCAAGACAGAATTAATTATCTTTGA  >  NZ_CP009273/565861‑565950

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑