Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	2028183	2028230	48	2 [1]	[1] 2	ompC	porin OmpC

GGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGC  >  NZ_CP009273/2028093‑2028187                                                                                          |      ggTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTg       <  2:253477/90‑1 (MQ=255)      tggtgATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGtgc  >  1:20418/1‑90 (MQ=255)                                                                                          |      GGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGC  >  NZ_CP009273/2028093‑2028187

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑