Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP009273 | 1,174,948 | T→C | H300H (CAT→CAC) | nagK → | N‑acetylglucosamine kinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP009273 | 1,174,948 | 0 | T | C | 100.0% | 36.5 / NA | 11 | H300H (CAT→CAC) | nagK | N‑acetylglucosamine kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (7/4); total (7/4) |
TGTAGCTCGTGTTCCGCGCATTGAACGCGCGCGCCACGGTGATGCGGGAGGAATGCGTGGTGCGGCCTTCCTACATCTAACCGATTAAACAACAGAGGTTGCTATGCTGTCGCGTCGGGGTCATCGGTTAAGTCGTTTTCGTAAAAATA > NZ_CP009273/1174873‑1175021 | tGTAGCTCGTGTTCCGCGCATTGAACGCGCGCGCCACGGTGATGCGGGAGGAATGCGTGGTGCGGCCTTCCTACACCTAACCGATTAaac < 1:101779/90‑1 (MQ=255) gtgtTCCGCGCATTGAACGCGCGCGCCACGGTGATGCGGGAGGAATGCGTGGTGCGGCCTTCCTACACCTAACCGATTAAACAACAGAgg > 1:365582/1‑90 (MQ=255) ttCCGCGCATTGAACGCGCGCGCCACGGTGATGCGGGAGGAATGCGTGGTGCGGCCTTCCTACACCTAACCGATTAAACAACAGAGGTTg > 2:300079/1‑90 (MQ=255) gcATTGAACGCGCGCGCCACGGTGATGCGGGAGGAATGCGTGGTGCGGCCTTCCTACACCTAACCGATTAAACAACAGAGGTTGCTATGc < 2:114428/90‑1 (MQ=255) gcCACGGTGATGCGGGAGGAATGCGTGGTGCGGCCTTCCTACACCTAACCGATTAAACAACAGAGGTTGCTATGCTGTCGCGTCGGGGTc > 2:590653/1‑90 (MQ=255) gCGGGAGGAATGCGTGGTGCGGCCTTCCTACACCTAACCGATTAAACAACAGAGGTTGCTATGCTGTCGCGTCGGGGTCATCGGTTAAGt > 1:300332/1‑90 (MQ=255) gtggtgCGGCCTTCCTACACCTAACCGATTAAACAACagag < 1:222999/41‑1 (MQ=255) gtggtgCGGCCTTCCTACACCTAACCGATTAAACAACagag > 2:222999/1‑41 (MQ=255) gtggtgCGGCCTTCCTACACCTAACCGATTAAACAACaga < 1:377388/40‑1 (MQ=255) gtggtgCGGCCTTCCTACACCTAACCGATTAAACAACaga > 2:377388/1‑40 (MQ=255) gtgCGGCCTTCCTACACCTAACCGATTAAACAACAGAGGTTGCTATGCTGTCGCGTCGGGGTCATCGGTTAAGTCGTTTTCGTAAAAATa > 2:98567/1‑90 (MQ=255) | TGTAGCTCGTGTTCCGCGCATTGAACGCGCGCGCCACGGTGATGCGGGAGGAATGCGTGGTGCGGCCTTCCTACATCTAACCGATTAAACAACAGAGGTTGCTATGCTGTCGCGTCGGGGTCATCGGTTAAGTCGTTTTCGTAAAAATA > NZ_CP009273/1174873‑1175021 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |