Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	1459439	1459482	44	3 [2]	[2] 3	BW25113_RS25580	hypothetical protein

ATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATA  >  NZ_CP009273/1459349‑1459461                                                                                          |                        ataAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAAt                         >  1:776141/1‑90 (MQ=255)   aaaGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAAtgt                       >  1:98193/1‑90 (MQ=255)                        tctGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATttata  <  2:745027/90‑1 (MQ=255)                                                                                          |                        ATAAAGCAGAGTTATGTTTAAGCTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATA  >  NZ_CP009273/1459349‑1459461

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑