Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	3644313	3644708	396	3 [1]	[0] 4	[BW25113_RS18155]	[BW25113_RS18155]

GCACAACAAATACCGATAATGCTAAAACGCCAGACACACCGAAGTGGCCTTGCGATAATTGGGAAGAACAACAACCCATTAATTCCACAT  >  NZ_CP009273/3644709‑3644798 |                                                                                          gCACAACAAATACCGATAATGCTAAAACGCCAGACACACCGAAGTGGCCTTGCGATAATTGGGAAGAACAACAACCCATTAATTCCACAt  >  1:243276/1‑90 (MQ=255) gCACAACAAATACCGATAATGCTAAAACGCCAGACACACCGAAGTGGCCTTGCGATAATTGGGAAGAACAACAACCCATTAATTCCACAt  >  1:477464/1‑90 (MQ=255) gCACAACAAATACCGATAATGCTAAAACGCCAGACACACCGAAGTGGCCTTGCGATAATTGGGAAGAACAACAACCCATTAATTCCACAt  >  1:63984/1‑90 (MQ=255) gCACAACAAATACCGATAATGCTAAAACGCCAGACACACCGAAGTGGCCTTGCGATAATTGGGAAGAACAACAACCCATTAATTCCACAt  >  2:289380/1‑90 (MQ=255) |                                                                                          GCACAACAAATACCGATAATGCTAAAACGCCAGACACACCGAAGTGGCCTTGCGATAATTGGGAAGAACAACAACCCATTAATTCCACAT  >  NZ_CP009273/3644709‑3644798

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑