Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	3630096	3631276	1181	2 [1]	[0] 2	[yhiN]–[pitA]	[yhiN],[pitA]

TGGCCTTGCCATGGTGTTCTCTATGTTGCTGGCGGCGATT  >  NZ_CP009273/3631277‑3631316 |                                        tGGCCTTGCCATGGTGTTCTCTATGTTGCTGGCGGCGAtt  >  1:502445/1‑40 (MQ=255) tGGCCTTGCCATGGTGTTCTCTATGTTGCTGGCGGCGAtt  <  2:502445/40‑1 (MQ=255) |                                        TGGCCTTGCCATGGTGTTCTCTATGTTGCTGGCGGCGATT  >  NZ_CP009273/3631277‑3631316

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑