| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP009273 | 360104 = | NA (NA) | 49 (2.030) | 28/168 | 0.0 | NA | intergenic (‑35/+251) | lacZ/BW25113_RS23320 | beta‑galactosidase/relaxase/mobilization nuclease domain‑containing protein |
| ? | NZ_CP009273 | = 360286 | NA (NA) | intergenic (‑217/+69) | lacZ/BW25113_RS23320 | beta‑galactosidase/relaxase/mobilization nuclease domain‑containing protein | |||||
CAGGAGAGCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTAATGTCATGGGAAGATCCAGCCGACCAGGCTT > NZ_CP009273/360198‑360373 | cAGGAGAGCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGgggaattg < 1:395017/90‑1 (MQ=39) ggAGAGCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGgggaattggg > 2:239340/1‑90 (MQ=255) ggAGAGCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGgggaattggg > 2:593762/1‑90 (MQ=255) gagCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGgggaattgggaat > 2:196925/1‑90 (MQ=255) gagCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGgggaattgggaat > 1:123107/1‑90 (MQ=255) gCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTTGATGCCTGgggaattgggaatt > 1:679371/1‑90 (MQ=255) gCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGaatta > 1:560829/1‑90 (MQ=255) gCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGaatta > 2:452706/1‑90 (MQ=255) gCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGaatta > 1:436285/1‑90 (MQ=255) cGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGaattaa > 2:380852/1‑90 (MQ=255) ttCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGaattaatt > 1:341343/1‑90 (MQ=255) cACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCt > 2:44955/1‑90 (MQ=255) cACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCt > 1:565832/1‑90 (MQ=255) aaacaaCAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTATTTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGa < 2:679371/90‑1 (MQ=255) gATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGc > 1:364182/1‑90 (MQ=255) gATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGc > 1:597643/1‑90 (MQ=255) tAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCt < 2:215744/90‑1 (MQ=255) aaaaCGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTc < 1:380852/90‑1 (MQ=255) aaaaCGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTc < 2:71399/90‑1 (MQ=255) aaCGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGt > 2:684097/1‑90 (MQ=255) aaCGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGt > 1:557310/1‑90 (MQ=255) aaCGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGt > 1:581080/1‑90 (MQ=255) gAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGAt < 1:103022/90‑1 (MQ=255) aaaGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATa > 1:235231/1‑90 (MQ=255) ccAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTa < 1:446531/90‑1 (MQ=255) ccAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTa < 1:615662/90‑1 (MQ=255) aGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTAtt > 2:97769/1‑90 (MQ=255) ttCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTtat < 1:684097/90‑1 (MQ=255) ttCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTtat < 1:489647/90‑1 (MQ=255) tCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTtata < 1:333362/90‑1 (MQ=255) tGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGAt > 2:547512/1‑70 (MQ=255) tGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGAt < 1:547512/70‑1 (MQ=255) tGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTa > 1:500635/1‑90 (MQ=255) tGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTa > 1:265588/1‑90 (MQ=255) tGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTa > 2:539377/1‑90 (MQ=255) tGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTa > 1:580830/1‑90 (MQ=255) gAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTaa < 1:612101/90‑1 (MQ=255) gAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTaa < 1:97769/90‑1 (MQ=255) ttCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTAATGTCAt < 1:111740/90‑1 (MQ=255) a‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCt < 1:527342/61‑1 (MQ=255) a‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCt > 2:527342/1‑61 (MQ=255) aTGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTAATGTCATGGGAAGATCCAGc > 2:551195/1‑90 (MQ=255) ggggAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTAATGTCATGGGAAGATCCAGCCGACCa < 1:586091/90‑1 (MQ=255) gaattgggaattAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTAATGTCATGGGAAGATCCAGCCGACCAGGc < 1:147114/90‑1 (MQ=255) attgggaattAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTAATGTCATGGGAAGATCCAGCCGACCAGGCtt > 1:649526/1‑90 (MQ=255) attgggaattAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTAATGTCATGGGAAGATCCAGCCGACCAGGCtt > 2:382091/1‑90 (MQ=255) | CAGGAGAGCGTTCACCGACAAACAACAGATAAAACGAAAGGCCCAGTCTTTCGACTGAGCCTTTCGTTTTA‑TTTGATGCCTGGGGAATTGGGAATTAATTCTTGAAGACGAAAGGGCCTCGTGATACGCCTATTTTTATAGGTTAATGTCATGGGAAGATCCAGCCGACCAGGCTT > NZ_CP009273/360198‑360373 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |