| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 3,632,157 | A→T | I386F (ATC→TTC) | pitA → | inorganic phosphate transporter PitA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 3,632,157 | 0 | A | T | 100.0% | 149.5 / NA | 39 | I386F (ATC→TTC) | pitA | inorganic phosphate transporter PitA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base T (24/15); total (24/15) | |||||||||||
TGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAG‑AAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAAT > NZ_CP009273/3632071‑3632239 | tGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAG‑AAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGttca > 1:127356/1‑90 (MQ=255) gAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAG‑AAACTGAAGTCCGACATGCTTAGAACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGt > 2:849504/1‑90 (MQ=255) cTGACGATCAGCGCCTGTTGAAG‑AAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCgcgc < 1:347864/90‑1 (MQ=255) cTGACGATCAGCGCCTGTTGAAG‑AAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCgcgc < 1:881101/90‑1 (MQ=255) tGACGATCAGCGCCTGTTGAAG‑AAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCt > 2:314090/1‑90 (MQ=255) gACGATCAGCGCCTGTTGAAG‑AAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTg > 2:50140/1‑90 (MQ=255) cAGCGCCTGTTGAAG‑AAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTa < 2:531980/90‑1 (MQ=255) aGCGCCTGTTGAAGAAAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTa < 2:13312/90‑1 (MQ=255) gcgcCTGTTGAAG‑AAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAgg > 1:414412/1‑90 (MQ=255) gTTGAAG‑AAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCt < 2:895523/75‑1 (MQ=255) gTTGAAG‑AAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCt > 1:895523/1‑75 (MQ=255) gTTGAAG‑AAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGGGTTAGGTATCgg > 2:529209/1‑90 (MQ=255) cTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGt > 2:812611/1‑70 (MQ=255) cTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGt < 1:812611/70‑1 (MQ=255) aaGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATtggc > 2:170064/1‑90 (MQ=255) gACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGgcgc < 2:590948/90‑1 (MQ=255) ttAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTgg < 2:414412/90‑1 (MQ=255) gCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCaa < 1:655412/90‑1 (MQ=255) aTCGAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGt < 1:181970/46‑1 (MQ=255) aTCGAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGt > 2:181970/1‑46 (MQ=255) aTCGAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGgcgc < 2:865083/75‑1 (MQ=255) aTCGAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGgcgc > 1:865083/1‑75 (MQ=255) aTCGAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGGAACGACt > 1:264992/1‑90 (MQ=255) aTCGAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACt > 2:397431/1‑90 (MQ=255) aTCGAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACt > 1:403390/1‑90 (MQ=255) aTCGAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGGACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACt > 2:503762/1‑90 (MQ=255) aTCGAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGGATCGGGACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACt > 1:39748/1‑90 (MQ=37) aTCGAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGGATCGGGACGATGATTGGCTGGCGCCGGGGGGCCACGACt > 1:689911/1‑90 (MQ=25) aTCGAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGGCGCGCTGGCGGTAGGTATCGGGACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACt > 1:703928/1‑90 (MQ=37) gAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCgcgc > 2:79280/1‑37 (MQ=255) gAGTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCgcgc < 1:79280/37‑1 (MQ=255) gTATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCgg < 1:50140/90‑1 (MQ=255) tATGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGGGGCAACGACTATTggg > 2:45327/1‑89 (MQ=37) tGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTga > 2:402886/1‑90 (MQ=255) tGCACCGGTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTga > 2:840097/1‑90 (MQ=255) ggTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCaa < 1:309298/71‑1 (MQ=255) ggTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCaa > 2:309298/1‑71 (MQ=255) ggTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCaa < 1:111219/71‑1 (MQ=255) ggTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCaa > 2:111219/1‑71 (MQ=255) ggTGTGGTTCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAAt > 1:151404/1‑90 (MQ=255) | TGCCTGGCGTGAGTGCTGACGATCAGCGCCTGTTGAAG‑AAACTGAAGTCCGACATGCTTAGCACCATCGAGTATGCACCGGTGTGGATCATCATGGCGGTCGCGCTGGCGTTAGGTATCGGTACGATGATTGGCTGGCGCCGTGTGGCAACGACTATCGGTGAGAAAAT > NZ_CP009273/3632071‑3632239 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |