Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NZ_CP009273	3763096	3763106	11	4 [1]	[1] 6	BW25113_RS26240	Imm57 family immunity protein

ATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTTAAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGTTTTTT  >  NZ_CP009273/3763105‑3763196   |                                                                                          atGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTTAAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGtttt    >  1:398887/1‑90 (MQ=255)   ggCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTTAAAAATATATTATTAACTCACTCTCCAGGAGtttttt  >  2:30952/1‑90 (MQ=255)   ggCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTTAAAAATATATTAATAactcac                  <  1:357946/74‑1 (MQ=255)   ggCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTTAAAAATATATTAATAactcac                  >  2:357946/1‑74 (MQ=255)   ggCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTTAAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGtttttt  >  2:129733/1‑90 (MQ=255)   ggCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTTAAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGtttttt  >  2:522220/1‑90 (MQ=255)   |                                                                                          ATGGCCATTGATGATTCTATAAAGTGCATCGATGAATGATAACTTAATTTTATTTAAAAATATATTAATAACTCACTCTCCAGGAGTTTTTT  >  NZ_CP009273/3763105‑3763196

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑