| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP009273 | 1,196,737 | (C)5→4 | coding (100/312 nt) | BW25113_RS25530 ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP009273 | 1,196,733 | 0 | C | . | 100.0% | 41.0 / NA | 11 | coding (104/312 nt) | BW25113_RS25530 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base . (8/3); total (8/3) | |||||||||||
GTAAAAAGGGCGGTACCAGAAAGGACTAAGGAAAAAACTGGTACCGCCAAGACTACACACAGCATAAAGTTGTGGTGTCGGGTGCCCCCGGTGCCTGGCGAAGGTTGCACACCAGGCGGGTGGGTATCCACAGAAGGTCGATTGTCAGCCTCAACCTTAACC > NZ_CP009273/1196649‑1196810 | gTAAAAAGGGCGGTACCAGAAAGGACTAAGGAAAAAACTGGTACCGCCAAGACTACACACAGCATAAAGTTGTGGTGTCGGGTGccccgg < 2:271940/90‑3 (MQ=255) cacacaGCATAAAGTTGTGGTGTCGGGTG‑CCCCGGTGCCTGGCGAAGGTTGCACACCAGGCGGGTGGGTATCCACAGAAGGTCGATTGTc < 1:118378/90‑1 (MQ=255) caGCATAAAGTTGTGGTGTCGGGTG‑CCCCGGTGCCTGGCGAAGGTTGCACACCAGGCGGGTGGGTATCCACAGAAGGTCGATTGTCAGcc > 1:181951/1‑90 (MQ=255) caGCATAAAGTTGTGGTGTCGGGTG‑CCCCGGTGCCTGGCGAAGGTTGCACACCAGGCGGGTGGGGATCCACAGAAGGTCGATTGTCAGcc > 2:143864/1‑90 (MQ=255) caGCATAAAGTTGTGGAGTCGGGTG‑CCCCGGCGGCTGCCGAAGGGTGCACACCAGGCGGGGGGGGATCCACAGAAGGGCGGGTGTCAGcc > 2:143863/1‑90 (MQ=255) aGCATAAAGTTGTGGTGTCGGGTG‑CCCCGGTGCCTGGCGAAGGTTGCACACCAGGCGGGTGGGTATCCACAGAAGGTCGATTGTCAGCCt > 1:128575/1‑90 (MQ=255) gCATAAAGTTGTGGTGTCGGGTG‑CCCCGGTGCCTGGCGAAGGTTGCACACCAGGCGGGTGGGTATCCACAGAAGGTCGATTGTCAGCCTc < 2:241436/90‑1 (MQ=255) gtggtgTCGGGTG‑CCCCGGTGCCTGGCGAAGGTTGCACACCAGGCGGGTGGGTATCCACAGAAGGTCGATTGTc < 1:209959/74‑1 (MQ=255) gtggtgTCGGGTG‑CCCCGGTGCCTGGCGAAGGTTGCACACCAGGCGGGTGGGTATCCACAGAAGGTCGATTGTCAGCCTCAACCTTAAcc > 1:23268/1‑90 (MQ=255) gtggtgTCGGGTG‑CCCCGGTGCCTGGCGAAGGTTGCACACCAGGCGGGTGGGTATCCACAGAAGGTCGATTGTCAGCCTCAACCTTAAcc > 2:127011/1‑90 (MQ=255) gtggtgTCGGGTG‑CCCCGGTGCCTGGCGAAGGTTGCACACCAGGCGGGTGGGTATCCACAGAAGGTCGATTGTCAGCCTCAACCTTAAcc > 2:267072/1‑90 (MQ=255) gtggtgTCGGGTG‑CCCCGGTGCCTGGCGAAGGTTGCACACCAGGCGGGTGGGGATCCACAGAAGGTCGATTGTc > 2:209959/1‑74 (MQ=255) | GTAAAAAGGGCGGTACCAGAAAGGACTAAGGAAAAAACTGGTACCGCCAAGACTACACACAGCATAAAGTTGTGGTGTCGGGTGCCCCCGGTGCCTGGCGAAGGTTGCACACCAGGCGGGTGGGTATCCACAGAAGGTCGATTGTCAGCCTCAACCTTAACC > NZ_CP009273/1196649‑1196810 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 7 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |